Líneas de Investigación / Líneas de Trabajo

Como el Técnico Responsable del LabMicroLas, Gastón Contreras brinda asesoría y asistencia técnica en la microdisección láser y en las técnicas de microscopía convencionales con las que cuenta el LabMicroLas. El servicio se ofrece a toda la comunidad académica del Instituto de Ecología, a los demás institutos y dependencias de la UNAM e incluso, a entidades externas. Los servicios que actualmente se ofrecen en el LabMicroLas son: 

1. Corte y aislamiento de tejidos biológicos o células individuales de cultivos celulares mediante la técnica de microdisección láser para la extracción y purificaión de biomoléculas (ácidos nucleicos, proteínas, metabolitos) con el sistema ArcturusXT - Nikon Eclipse Ti y su posterior análisis genómico, transcriptómico, proteómico y/o metabolómico.

2. Observación y adquisición de imágenes por microscopía óptica (Campo claro, contraste de fases, Nomarski, fluorescencia) con los microscopios Nikon Eclipsse Ti y MacroView Nikon AZ100M.

 

                                ArcturusXT - Nikon Eclipse Ti  Nikon AZ100M

LabMicroLas

 

 

 

 

 

 

 

 


 

Formación Académica

  • Doctorado en Química, UQÀM. Departamento de Química y Bioquímica de la Facultad de Ciencias; Montreal, Quebec, Canadá. 
    Tesis: "Development of Biosensors Based on Aptamers for the Detection and Quantification of Hormonal Pollutants into Water". 
    (2013 - 2017)
     
  • Doctorado en Ciencias de la Energía y de los Materiales, INRS. Instituto Nacional de la Investigación Científica - Energía, Materiales y Telecomunicaciones; Varennes, Quebec, Canadá. 
    Proyecto: "Development of DNA-based Optical Biosensors for Emerging Contaminants Detection". 
    (2011 - 2013)- Pgm. parcial.
     
  • Maestría en Ciencias (Química Analítica), UAEM, Centro de Investigaciones Químicas de la Facultad de Ciencias; Cuernavaca, Morelos.
    Tesis: "Determinación del índice de refracción complejo de análogos de aerosoles de la atmósfera de Titán usando las ecuaciones de Abelès".
    (2008 - 2011)
     
  • Licenciatura en Ciencias (Química), UAEM, Facultad de Ciencias.
    Tesis: "Caracterización física y química de análogos de aerosoles de la atmósfera de Titán".
    (2002 - 2008)

Experiencia profesonal

  • Técnico Académico Titular "B", T. C. (Febrero/2019 - Actualidad). Unidad de Servicios y Apoyo Técnico del Instituto de Ecología, UNAM.
     
  • Técnico Microscopista por Honorarios de Tiempo Completo (Mayo/2018 - Diciembre/2018). Laboratorio Nacional de Microscopía Avanzacada, Instituto de Biotecnología, UNAM.
    Con fondos del LNMA.
    Supervisor: Dr. Christopher Wood
     
  • Posdoctorado, T. C. (Mayo/2017 - Abril/2018). Consorcio de Fisiología del Espermatozoide y Laboratorio Nacional de Microscopía Avanzacada, Instituto de Biotecnología, UNAM.
    Por Proyecto de CONACYT.
    Asesores: Dr. Alberto Darszon y Dr. Christopher Wood

     

 

 

Premios y Distinciones

1. Sistema Nacional de Investigadores (SNI):

SNI Nivel C (enero 2019-diciembre 2022).
 

2. Programa de Estímulos al Personal Académico por Equivalencia:

Nivel “B”. 

3. Aceptado al Programa de Estímulos a la Iniciación del Personal Académico

4. Beca de doctorado; Le Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT), Beca completa otorgada por el gobierno de Quebec (Canadá) para estudiantes extranjeros de $25 000 CAD/año. Program 1M. De 2011/03 a 2013/12.


 

 


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Proyectos de Investigación Propios

1. (2020) Desarrollo de Biosensores Electroquímicos para la Detección in-vitro de ARN Viral del SARS-CoV-2 y de Anticuerpos Generados por COVID-19.

Como un esfuerzo más por controlar la pandemia de COVID-19, y para prepararnos a eventos similares en el futuro, estamos desarrollando biosensores electroquímicos para la detección rápida 1) de anticuerpos generados por COVID-19, en el que se utilizan las proteínas del virus como receptores (Inmunosensor) y la detección 2) del RNA viral del SARS-CoV-2 mediante el uso de secuencias de DNA sintético complementario a regiones únicas del genoma viral (Genosensor), en celdas de 3 electrodos.

 

Proyectos de Investigación en Colaboración

 

1. Dinámicas Moleculares y Celulares Durante el Desarrollo Estudiadas en Vivo: De los Nichos de Células Troncales de Plantas al Sistema Nervioso de los Humanos

Coordinado por la Dra. Elena Álvarez-Buylla.
 

Observación de raíces de Arabidopsis por microscopía de fluorescencia.

Reconstrucción de imágenes en 3D. Procesamiento y Análisis de Imágenes Adquirirdas por Microscopía

 

2. Los Patrones de Turing en la Distribución de Tricomas en las Hojas de Arabidopsis Thaliana

Coordinado por la Dra. Elena Álvarez-Buylla y el Dr. Joel Stavans (Weizmann Institute of Science, Israel)
 

Conteo de tricomas en hojas de Arabidopsis, Wildtyoe y mutantes.

 

 

Academic Profile:


Total Citations: 333
H-Index: 7
i10-Index: 5

 

International Papers

2023

Go to ACS Agricultural Science & Technology 8. Luis V. Pedrero-López*, César M. Flores-Ortiz, Blanca Pérez-García, ..., Gastón Contreras-Jiménez, Alma Orozco-Segovia*. Non-chlorophyllous and crypto-chlorophyllous fern spores differ in their mobilisation of fatty acids during priming. Physiologia Plantarum, 175, 1, 38–48.
DOI: https://doi.org/10.1111/ppl.13848
JIF: 6.2
Citations: 0

 

2021

Go to ACS Agricultural Science & Technology 7. Siham Chergui, Khaled Rhili, Juan Carlos Abrego-Martinez, Gastón Contreras Jiménez, and Mohamed Siaj*. Selection of Highly Specific Aptamers by Graphene Oxide-SELEX to Ultrasensitive Label-Free Impedimetric Biosensor Development for Glyphosate Detection. ACS Agricultural Science & Technology, 1, 6, 655–663.
DOI: https://doi.org/10.1021/acsagscitech.1c00147
JIF: 2.5
Citations: 7

 

2020

Membranes for Water and Wastewater Treatment | MDPI Books6. N’Diaye, Jeanne, Sujittra Poorahong, Ons Hmam, Gastón Contreras Jiménez, Ricardo Izquierdo, and Mohamed Siaj*. Reduced Graphene Oxide-Based Foam as an Endocrine Disruptor Adsorbent in Aqueous Solutions. MDPI Membranes, 10, no. 11: 340.
DOI: https://doi.org/10.3390/membranes10110340
JIF: 4.5
Citations: 8
 

2019

Renesh Bedre5. Mehennaoui S., Poorahong S., Contreras Jimenez G., Siaj M.*. Selection of high affinity aptamer-ligand for dexamethasone and its electrochemical biosensor. Nature Scientific Reports 9:6600.
DOI: doi: 10.1038/s41598-019-42671-3
JIF: 4.6
Citations: 37

 

2018
Journal of Cell Science Catalogue en ligne4. Romarowski, A.; Velasco Félix, Á. G.; Torres Rodríguez, P.; Gervasi, M. G.; Xu, X.; Luque, G. M.; Contreras-Jiménez, G.; ...; Krapf, D.; Visconti, P. E.; Krapf, D.; Guerrero, A.; Darszon, A.; Buffone, M. G*. Super-resolution imaging of live sperm reveals dynamic changes of the actin cytoskeleton during acrosomal exocytosis. Journal of Cell Science, 131: jcs.218958.
DOI: doi: 10.1242/jcs.218958
JIF: 5.3
Citations: 24

 

2015
Current issue - Nano Research3. Eissa, S.; Contreras Jimenez, G.; Mahvash, F.; Guermoune, A.; Tlili, C.; Szkopek, T.; Zourob, M.; Siaj, M*. Functionalized CVD monolayer graphene for label-free impedimetric biosensing. Nano Research 8:1698-1709.
DOI: doi:10.1007/s12274-014-0671-0 
JIF: 10.2
Citations: 65

 

Analytical Chemistry - Home | Facebook2. Contreras Jimenez, G.; Eissa, S.; Ng, A.; Alhadrami, H.; Zourob, M*.; Siaj, M*. Aptamer-based label-free impedimetric biosensor for detection of progesterone. ACS Analytical Chemistry 87:1075-1082.
DOI: doi:10.1021/ac503639s 
JIF: 8.0
Citations: 150

 

2010
Atmospheric Chemistry and Physics - Wikipedia1. Voss, P. B.*; Zaveri, R. A.; Flocke, F. M.; Mao, H.; Hartley, T. P.; DeAmicis, P.; Deonandan, I.; Contreras-Jiménez, G.; et al. Long-range pollution transport during the MILAGRO-2006 campaign: a case study of a major Mexico City outflow event using free-floating altitude-controlled balloons. Atmospheric Chemistry and Physics 10:7137-7159.
DOI: doi.org/10.5194/acp-10-7137-2010
JIF: 7.2
Citations: 35


 

Outreach Articles

2016

XXIX CONGRESO DE INVESTIGACIÓN2. G. Contreras Jiménez. 2016. Los Aptámeros: ADN que se usa en sensores para la detección de compuestos químicos. La Unión de Morelos. Academia de Ciencias de Morelos, p26-27.

 

 

 

No. 214 Revista ¿Cómo ves? - Dirección General de Divulgación de la Ciencia  de la UNAM1. G. Contreras Jiménez. 2011. Las brumas de Titán. ¿Cómo ves? 13(154):16-19.
 

 

 

 

 

Acknowledgements in Scientific Articles

 

2020

3. Chávez, J. C., et al. Quantitative Intracellular pH Determinations in Single Live Mammalian Spermatozoa Using the Ratiometric Dye SNARF-5F, Frontiers in Cell and Developmental Biology, 7:366 (2020).
doi: https://doi.org/10.3389/fcell.2019.00366

2019

2. Solano-De la Cruz, M.T., Adame-García, J., Gregorio-Jorge, J. et al. Functional categorization of de novo transcriptome assembly of Vanilla planifolia Jacks. potentially points to a translational regulation during early stages of infection by Fusarium oxysporum f. sp. vanillae, BMC Genomics 20, 826 (2019).
doi.org/10.1186/s12864-019-6229-5

2004

1. Flores-Sánchez, P., Escalante J. and Castillo E. Enzymatic resolution of N-Protected-β3-Amino Methyl Esters, using Lipase B from Candida Antarctica. Tetrahedron asymmetry, 16:629–634 (2005).
doi.org/10.1016/j.tetasy.2004.11.082

 

Tesis Dirigidas

* * *

 

 

 

Agradecimientos en Tesis


2018
5. José Pablo Ocelotl Oviedo. 2018. Estudio de la actividad unitaria del receptor P2X4 humano por fluorescencia. Instituto de Biotecnología – UNAM. Cuernavaca, Mor. MEX.

2016
4. Mohammed Alahmadi. 2016. Encapsulation de nanoparticules à base de carbure de fer magnétique: synthèse, fonctionnalisation et application. Faculté de Sciences, UQÀM, Montreal, QC, Canada.
3. Somia Mehennaoui. 2016. Développement d’une plateforme électrochimique à base d’aptamère pour la biodétection de la dexaméthasone dans l’eau. Faculté de Sciences, UQÀM, Montreal, QC, Canada.

2015
2. Mohammadali Safavieh: 2015. Development of Lab On A Chip Platforms for Bacteria Detection Based on Loop.Mediated Isothermal Amplification. INRS – EMT, Varennes, QC, Canada.
1. Shimaa Hassan Hassan Eissa. 2015. Electrochemical Biosensors for foodborne contaminants based on aptamers and graphene materials. INRS – EMT, Varennes, QC, Canada.