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Luisa Isaura Falcón Alvarez

Semblanza

Estudié la licenciatura de Biología en la Facultad de Ciencias de la UNAM, Maestrías en Ciencias en el Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, UNAM y en la Université Aix Marseille, obtuve el grado de doctora en Ciencias en la Universidad de Stony Brook. Desde el 2006 me desempeño como Investigadora Titular en el Instituto de Ecología, donde fundé el Laboratorio de Ecología Bacteriana, mismo que es parte de la Unidad Mérida de dicho instituto. He sido profesora invitada en la Universidad de Kyoto, Japón y en el Lawrence Berkeley National Laboratory, EUA.

 

Me he especializado en el estudio de ecología microbiana y trabajo con tapetes microbianos, microbialitos y biofilms en diferentes ambientes acuáticos, incluyendo regiones tropicales, templadas y polares. Recientemente, he comenzado a trabajar con microbioma de fauna silvestre. Soy autora de varios trabajos de investigación, divulgación y capítulos de libro. Contribuyo con iniciativas que busquen el desarrollo sostenible en diversos sitios de estudio.

 

Líneas de Investigación

Estudio la diversidad genética bacteriana para comprender la función de diferentes ecosistemas. Las bacterias se encuentran en la base de la gran mayoría de los ciclos biogeoquímicos al tener una alta diversidad metabólica, resultado de su antigua historia evolutiva. Trabajo con técnicas moleculares y de microbiología clásica para identificar el papel que juegan diferentes grupos metabólicos bacterianos en la biogeoquímica global. Dentro de la gran diversidad bacteriana, las cianobacterias son mis preferidas por su capacidad de hacer fotosíntesis oxigénica, anoxigénica y fijación de N2, lo cual las vuelve esenciales en una serie de ecosistemas tanto acuáticos como terrestres. Me he especializado en la ecología de cianobacterias de ambientes acuáticos, específicamente en las fijadoras de N2. Los microbialitos y tapetes microbianos son nuestro modelo principal de estudio en ambientes tropicales, templados y polares. Conforme avanza el conocimiento de la ecología y evolución microbiana se vuelve evidente el papel fundamental de los microorganismos- buscamos integrar el aporte del microbioma a la salud, ecología y evolución de sus hospederos.

Palabras Clave: Biogeoquímica, nitrógeno, carbono, cianobacterias, fijación de N2, diversidad bacteriana, microbialitos, microbioma, tapetes microbianos

Formación Académica

Licenciatura

Biología, Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ciencias (1994-1998).

Maestría

Maestría en Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Ciencias del Mar y Limnologí a (1998-2000).

Grado obtenido: Maestría en Ciencias.

Diplome d`Etudes Approfondies (DEA), Université de la Mediterrannée, Marseille, Faculté des Sciences de Luminy, Francia (1999-2000).

Doctorado

Ph D.Marine Sciences Research Center, Stony Brook University, EUA.

(2000-2003). Disciplina: Oceanografía costera; Subdisciplina: Ecología microbiana.Tesis: Unicellular Nitrogen Fixing Cyanobacteria from the Tropical North Atlantic and Subtropical North Pacific Oceans. Asesor: Edward J Carpenter.

Postdoctorado en el Instituto de Ecología (2004-2006). Estancias de investigación con Birgitta Bergman (Suecia), Andrei Chistoserdov (USA), Frank Cipriano (USA), Rutger deWitt (Francia).

Experiencia profesonal

 

UNAM, Instituto de Ecología. Investigadora Titular “C” de tiempo completo. Septiembre, 2021-

 

UNAM, Instituto de Ecología. Investigadora Titular “B” de tiempo completo. Mayo, 2015-septiembre, 2021.

 

Comisión académica en el Parque Científico y Tecnológico de Yucatán, UNAM. IE-LANCIS, Mérida. Enero, 2018-

 

Charité, Universitätsmedizin, Berlin, Alemania. Investigadora invitada. Septiembre-Noviembre, 2022.

  

 

Comisión académica en el Parque Científico y Tecnológico de Yucatán, UNAM. IE-LANCIS, Mérida. Enero, 2018-.

 

Center for Ecological Research, Kyoto University, Japón. Investigadora invitada- Mayo-Julio, 2017.

 

LBNL, UC Berkeley. Investigadora visitante- estancia sabática. Agosto 2013-2014.

 

Investigadora Titular “A” de tiempo completo. Agosto 29, 2008 – Mayo, 2015.

            Definitividad. Noviembre, 2010.

 

Investigadora Asociada “C” de tiempo completo. Septiembre 1, 2006-Agosto 28, 2008.

 

Estancia posdoctoral en el Departamento de Evolución Molecular, Instituto de   Ecología, UNAM. Laboratorio de la Dra. Valeria Souza. Agosto 2004 a Septiembre     2006.

 

Laboratorio de Edward J. Carpenter, San Francisco State University, Romberg   Tiburon Center, EUA. Asistente de investigación, 2000-2004.

Premios y Distinciones

Medalla Alfonso Caso por Maestría en Ciencias en el Instituto de Ciencias del Mar y Limnología (ICMyL) UNAM. 2003.

Becas por parte de: Stony Brook University, CONACyT, DGAPA, Columbia University, Smithsonian Institution

Beca L´Oréal para Mujeres en la Ciencia, 2008

Embajadora ISME para México

SNII nivel III

PRIDE D

Proyectos de Investigación Actuales

 

1. Quintana Roo: Santuario Internacional de Estromatolitos- esta iniciativa, lidereada por el Gran Acuífero Maya y el Profesor Arturo Bayona busca proteger a los ecosistemas que albergan a los arrecifes más antiguos, formados por bacterias. Nuestro equipo de trabajo colabora investigando la existencia de bioregiones de estromatolitos en la Península de Yucatán.

2. Arrecifes bacterianos en la laguna Bacalar, QR. Buscamos entender la diversidad microbiana que forma los estromatolitos de laguna Bacalar. Utilizamos técnicas genómicas, biogeoquímicas y de microbiología para entender estas comunidades y buscar su protección ante los cambios ambientales asociados a las actividades atropogénicas que impactan la salud del acuífero.

3. Cianobacterias como catalizadoras de la precipitación de minerales carbonatados. Estamos investigando los mecanismos celulares que promueven la precipitación mineral asociada a cianobacterias, a partir de enfoques fisiológicos, de imagen química y genómicos.

4. Ecología de tapetes microbianos Antárticos. Mediante convenios de cooperación internacional apoyados por la AMEXCID-SRE, somos parte de un consorcio de investigación que busca entender cómo interactúan las comunidades formadoras de tapetes en Antártida y su papel en el ciclaje de los elementos constitutivos de la materia.

5. Ecología microbiana de manglares en la Península de Yucatán. Buscamos entender si existen microbiomas específicos para diferentes especies de mangle, al igual que la diversidad asociada a los bosques pristinos/degradados.

6. Microbioma de fauna silvestre. A la fecha hemos logrado discernir que algunas especies de murciélagos presentan cambios en su microbioma asociados al estadio reproductivo y región geográfica y tenemos varios proeyctos que trabajan con modelos animales para entender la historia de vida de los mismos desde una perspectiva del microbioma.

7. Microbioma de la salud humana. México es un país con grandes diferencias culturales y sociales, mismas que estudiamos desde el microbioma en poblaciones rurales y urbanas para comprender fenómenos de salud y enfermedad en colaboración con diferents grupos de trabajo.

Publicaciones

 

Artículos indexados

  1. Torres-Huesca J, et al. Diversity and structure of prokaryotic assemblages in a thermally stratified tropical lake (aceptado, Limnology)

  2. Ruiz-Torres NG, et al. A new genus and species of Microphalloidea (Digenea), parasite of Pteropteryx spp. (Chiroptera: Emballonuridae) from the Neotropical region of Mexico revealed by morphological and phylogenetic analyses (aceptado, J of Helminthology)

  3. Esguerra, D et al. Do restoration strategies in mangroves recover microbial diversity? A case study in the Yucatan peninsula (2024) PLoS One, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0307929

  4. Sánchez-Soto MF, Gaona O, Vigueras-Galván AL, Suzán G, Falcón LI, Vázquez-Domínguez E (2024) Prevalence and transmission of the most relevant zoonotic and vector-borne pathogens in the Yucatan peninsula: A review. PLoS Negl Trop Dis 18(7): e0012286. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0012286

  5. Hawes I, García-Maldonado JQ and Falcón LI (2024) Editorial: Exploring microbial mat communities in extreme environments. Front. Microbiol. 15:1440619. doi: 10.3389/fmicb.2024.1440619

  6. Ramírez-Carrillo E, G-Santoyo I, López-Corona O, Rojas-Ramos O, Falcón LI, Gaona O, Cerqueda-García D, Sánchez-Quinto A, de la Fuente Rodríguez RM, Hernández Castillo A, Nieto J. Similar connectivity of gut microbiota and brain activity networks is mediated by animal protein and lipid intake in children from a Mexican indigenous population (2023) Plos One, 8 (6), e0281385, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0281385

  7. Gómez-Acata ES, Teutli C, Falcón LI*, García-Maldonado JQ, Prieto-Davó A, Yanez-Montalvo A, Cadena S, Chiappa-Carrara X, Herrera-Silveira J. Microbial community structure associated to different ecological types of mangrove sediments in Celestún, a coastal lagoon in the Yucatan Peninsula, Mexico (2023) PeerJ, 11:e14587 https://doi.org/10.7717/peerj.14587

  8. Burnie T, Power IM, Paulo C, Alçiçek H, Falcón LI, Lin Y, Wilson SA. Environmental and mineralogical controls on biosignature preservation in magnesium carbonate systems analogous to Jezero Crater, Mars (2023) Astrobiology, 23, 5. https://doi.org/ 10.1089/ast.2022.0111

  9. Águila B*, Yanez-Montalvo A*, Mercado-Juárez R. A*, Montejano G.A,, Becerra-Absalón I, Falcón L.I** Microbialites show distinct cyanobacterial phylogenetic structure and functional redundancy in Bacalar lagoon and Cenote Azul sinkhole, Yucatan peninsula, Mexico (2022) FEMS Microbiology Ecology 98 (5) https://doi.org/10.1093/femsec/fiac039

  10. Mejía O, Sánchez-Quinto A*, Gómez-Acata ES, Miranda FP, Falcón LI. Unraveling the gut microbiota composition of the genus Herichthys (Pisces:Cichlidae): What can we learn from museum specimens? (2022) Current Microbiology https://doi.org/10.1007/s00284-022-03047-5

  11. Yanez-Montalvo A*, Águila B*, Gómez-Acata ES, Guerrero-Jacinto M*, Oseguera LA, Falcón L.I.**, Alcocer J. Shifts in water column microbial composition associated to lakes with different trophic conditions: “Lagunas de Montebello” National Park, Chiapas, Mexico (2022) PeerJ 10(e13999) https://doi.org/10.7717/peerj.13999

  12. Suárez-Moo P, Remes-Rodríguez CA*, Márquez-Velázquez NA, Falcón LI, García-Maldonado JG, Prieto-Davó A. Changes in the sediment microbial community structure of coastal and inland sinkholes of a karst ecosystem from the Yucatan peninsula (2022) Scientific Reports 12(1): 1-11 I.F. 3.998, Q1 https://doi.org/10.1038/s41598-022-05135-9

  13. Antelo V, Giménez M, Azziz G, Valdespino P, Falcón LI, Ruberto L, MacCormack W, Mazel D, Batista S. Metagenomic strategies identify diverse integron-integrase and antibiotic resistance genes in the Antarctic environment Microbiology Open 10(5), e1219 I.F. 3.142, Q2 https://doi.org/10.1002/mbo3.1219

  14. Sánchez-Quinto A*, Falcón LI. Formation and metabolic function of coral rubble biofilms in the reef ecosystem (2021) Gulf and Caribbean Research 32(1): 46-56. I.F. 0.27, Q4 https://doi.org/10.18785/gcr.3201.07  

  15. Yanez-Montalvo*, Gaona O, Aguila B*, Arias-Domínguez N, Falcón LI, Pérez-Flores J. Tapirus bairdii associated fecal microbiome from a critical conservation area: Calakmul, Mexico (2021) Current Microbiology I.F. 1.746, Q4 https://doi.org/10.1007/s00284-021-02531-8

  16. de Jesús-Navarrete, A., Yanez-Montalvo, A*., Falcón, LI et al. Nematode fauna associated with freshwater microbialites in Bacalar Lake, Quintana Roo, Mexico (2021) Limnology I.F. 1.62, Q2 https://doi.org/10.1007/s10201-021-00662-2 

  17. Águila B*, Alcántara-Hernández RJ, Montejano Zurita GA, López Martínez RA, Falcón LI, Absalón I. Cyanobacteria in microbialites of Alchichica crater lake: a polyphasic characterization (2021) Europ. J. Phycology I.F. 2.756, Q1 https://doi.org/10.1080/09670262.2020.1853815

  18. Yanez-Montalvo A*, Águila B*, Gómez-Acata S, Maas-Vargas M, Cabanillas N, Vega A, Bahena H, Hernández-Arana H, Falcón LI**. Depth related structure and microbial composition of microbialites in a karst sinkhole, Cenote Azul, Mexico (2020) Geomicrobiology. I.F. 1.989, Q3 https://doi.org/10.1080/01490451.2020.1836086

  19. Sánchez-Soto MF, Cerqueda-García D, Alcántara-Hernández RJ, Pech D, Árcega-Cabrera F, Aguirre-Macedo ML, Falcón LI, García-Maldonado JQ. Assessing the diversity of benthic sulfate-reducing microorganisms in the Northwestern Gulf of Mexico by Illumina sequencing of dsrB gene (2020) Microbial Ecology https://doi.org/10.1007/s00248-020-01631-5

  20. Sánchez-Quinto A*, Cerqueda-García D, Falcón LI, Gaona O, Martínez-Correa S, Nieto J, González-Santoyo I. Gut microbiome in children from indigenous and urban communities in Mexico: Different subsistence models, different microbiomes (2020) Microorganisms. I.F. 4.152, Q2 https://doi.org/10.3390/microorganisms8101592 #1

  21. Aguilar-Rangel EJ, Prado BL, Vásquez-Murrieta MS., Estrada-de los Santos P, Siebe C, Falcón LI, Santillán J, Alcántara-Hernández RJ. Temporal analysis of the microbial communities in a nitrate-contaminated aquifer and the co-occurrence of anammox, n-damo and nitrous-oxide reducing bacteria (2020) Journal of Contaminant Hydrology. I.F. 2.347, Q2 https://doi.org/10.1016/j.jconhyd.2020.103657 #1

  22. Gaona O*, Cerqueda-García, D, Moya A., Neri-Barrios, X., Falcón LI**. Geographical separation and physiology drive differentiation of microbial communities of two discrete populations of the bat Leptonycteris yerbabuenae (2020) Microbiology Open. I.F. 3.142 https://doi.org/10.1002/mbo3.1022

  23. Gaona O., Cerqueda-García, D., Vázquez-Domínquez, G., Valdespino-Castillo, PM., Neri-Barrios, X., Falcón LI. Microbiota composition of the sebaceous patch of Leptonycteris yerbabuenae (2019) PLoS One https://doi.org/10.1371/journal.pone.0226239
  24. Vázquez-Pérez JA, Ortega Carrillo C, Iñiguez García MA, Romero-Espinoza I, Márquez García JE, Falcón LI, Torres M, Herrera MT. Alveolar microbiota profile in patients with human pulmonary tuberculosis and interstitial pneumonia. Microbial Pathogenesis (2019) https://doi.org/10.1016/j.micpath.2019.103851
  25. Sánchez Quinto, A, Falcón, LI. Metagenome of Acropora palmata coral rubble: potential metabolic pathways and diversity in the reef ecosystem. PloSOne 14 (2019) (8), e0220117. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0220117
  26. Gaona O, Gómez-Acata ES, Cerqueda-García D., Sánchez-Quinto A., Neri, X., Falcón LI. Fecal microbiota of different reproductive stages of the central population of the lesser-long nosed bat, Leptonycteris yerbabuenae. PloS One (2019) 14 (7), e0219982. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0219982
  27. Gómez-Acata ES, Centeno CM, Falcón LI. Methods for extracting ´omes from microbialites. Microbiological Methods (2019) https://doi.org/10.1016/j.mimet.2019.02.014
  28. Azziz G, Giménez M, Romero H, Valdespino-Castillo PM, Falcón LI, Batista S. Detection of presumed genes encoding beta-lactamases by sequence-based screening of metagenomes derived from Antarctic microbial mats. Frontiers of Environmental Science and Engineering (2019) 13 (3), 44 https://doi.org/10.1007/s11783-019-1128-1
  29. Valdespino-Castillo PM, Cerqueda-García D, Batista S, Espinosa AC, Merino-Ibarra M, TaÅŸ N, Alcántara-Hernández RJ and Falcón LI. Microbial distribution and turnover in Antarctic microbial mats highlight the relevance of heterotrophic bacteria in low-nutrient environments. FEMS Microbial Ecology, https://doi.org/10.1093/femsec/fiy129 (2018).
  30. Valdespino-Castillo PM, Hu P, Merino-Ibarra M, López-Gómez LM, Cerqueda-Garcia D, González-De Zayas R, Pi-Puig T, Lestayo JA, Holman HYN, Falcón LI. Exploring biogeochemistry and microbial diversity of extant microbialites in Mexico and Cuba. Frontiers in Microbiology, 9 (2018).
  31. Alcántara-Hernández RJ, TaÅŸ N, Carlos-Pinedo S, Falcón LI, Durán-Moreno A. Microbial dynamics in anaerobic digestion reactors for treating organic urban residues during the start-up process. Letters in Applied Microbiology, 6, 438-445 (2017).
  32. Alcántara-Hernández, RJ., Valdespino, PM., Centeno, CM., Alcocer, J., Merino-Ibarra, M., Falcón, LI. Genetic diversity associated to N cycle pathways in microbialites from Lake Alchichica, Mexico. Aquatic Microbial Ecology, 78 (2) 121-133 (2017). https://doi.org/10.3354/ame01806
  33. Valdespino-Castillo PM., Alcántara-Hernández, RJ., Merino-Ibarra, M., Alcocer, J., Macek, M., Moreno-Guillén O., Falcón, LI. (2016). Phylotype dynamics of bacterial P utilization genes in microbialites and bacterioplankton of a monomictic endorheic lake. Microbial Ecology, 73 (2) 296-309.
  34. Cerqueda-García D, Falcón LI. Metabolic potential of microbial mats and microbialites: autotrophic capabilities desribed by an in silico stoichiometric approach from shared genomic resources. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 1650020 (2016). https:doi.org/10.1142/S0219720016500207
  35. Beltrán Y, Cerqueda-García D, TaÅŸ N., Thomé PE., Iglesias-Prieto R., Falcón LI. Microbial composition of biofilms associated with lithifying rubble of Acropora palmata branches. FEMS Microbiology Ecology, 92: 1 (2016). https:doi.org/10.1093/femsec/fiv162
  36. Centeno CM, Mejía O, Falcón LI. Habitat filtering drives phylogenetic structure of dominant bacterial phyla from microbialite communities in different locations across Mexico. Revista de Biología Tropical. 64, 3 (2016).
  37. Cerqueda-García, D., Falcón LI. La construcción del nicho y el concepto de holobionte, hacia la reestructuración de un paradigma. Revista Mexicana de Biodiversidad. 87 (1), 239-241 (2016).
  38. Carrillo-Araujo, M., TaÅŸ, N., Alcántara-Hernández, RJ., Gaona, O., Schondube, JE., Medellín, R., Jansson, JK., Falcón, LI. Phyllostomid bat microbiome composition is associated to feeding strategies. Frontiers in Microbiology 6: 447 (2015).
  39. Valdespino-Castillo, PM., Alcántara-Hernández, RJ., Alcocer, J., Merino-Ibarra, M., Macek, M. Falcón, LI. Alkaline phosphatases diversity of microbialites and bacterioplankton in Alchichica soda lake. FEMS Microbiology Ecology 90 (2), 504-519 (2014).
  40. Espinosa-Asuar, L., Escalante, AE., Falcón LI., Bonilla-Rosso, G., Ramírez-Barahona, S., Eguiarte LE., Souza V. Comparación de tres métodos moleculares para la descripción de una comunidad microbiana del canal de Yucatán. Hidrobiológica 24: 257-270 (2014).
  41. Cerqueda-García, D., Martínez-Castilla LP., Falcón, LI., Delaye L. Metabolic analysis of Chlorobium chlorochromatii CaD3 reveals clues of the symbiosis in ‘Chlorochromatium aggregatum’. ISME J 8, 991-998 (2014).
  42. Alcántara-Hernández, RJ., Centeno CM., Ponce-Mendoza, A., Batista, S., Merino-Ibarra, M., Campo, J., Falcón., LI. Characterization and comparison of potential denitrifiers in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica. Polar Biology, 37 (3), 403-416 (2014).
  43. Centeno, CM., Legendre, P., Beltrán, Y., Alcántara-Hernández, RJ., Lidstrom, U., Ashby, MN., Falcón, LI. Patterns in microbialite genetic composition relate to environmental variables. FEMS Microbiology Ecology 82: 724-735 (2012).
  44. Beltrán, Y., Centeno, CM., García-Oliva, F., Legendre, P., Falcón LI. Nitrogenase activity and associated diversity of microbialite and mat-forming communities from different environments in Mexico. Aquatic Microbial Ecology. (2012) 67: 15-24 (2012).
  45. Luo, YW., S.C. Doney, S. Bonnet, K.H. Boström, D. Böttjer4, D. G. Capone, E. J. Carpenter, Y.L. Chen, M.J. Church, L.I. Falcón, R.A. Foster, K. Furuya, K. Gundersen, S. Kitajima, R.J. Langlois, J. LaRoche, R. M. Letelier, P. H. Moisander, C.M. Moore, M. R. Mulholland, J. A. Needoba, K. M. Orcutt, A. J. Poulton, P. Raimbault, A. P. Rees, L. Riemann, T. Shiozaki, A. Subramaniam, T. Tyrrell, K. A. Turk, A. E. White, J. P. Zehr. Database for Diazotrophs in Global Ocean: Biomasses, nifH Copies and Nitrogen Fixation Rates. Earth System Science Data. 4, 47-73 (2012).
  46. Domínguez-Escobar J, Beltrán Y, Bergman B, Díez B, Ininbergs K, Souza V, Falcón LI. Phylogenetic and molecular clock inferences of cyanobacteria within Rivulariaceae from distant environments. FEMS Microbiology Letters, 316, 90-99 (2011).
  47. Falcón, LI., Magallón, S., Castillo A. Dating the cyanobacterial ancestor of the chloroplast. ISME Journal 4:777-783 (2010).
  48. Falcón, LI., Noguez, AM., Espinosa-Asuar, L., Fruns, L.E., Souza, V. Evidence of biogeography in surface ocean bacterioplankton assemblages. Marine Genomics, 1: 55-61 (2008).
  49. Deschamps, P., Plancke, C., Colleoni, C., Nakamura, Y., Suzuki, E., Putaux, JL., Buléon, A., Haebel, S., Steup, M., Falcón, LI., Moreira, D., Loffelhardt, W., d’Hulst, C., Dauvillée, D., and Ball, S. Metabolic symbiosis and the birth of the plant kingdom. Molecular Biology and Evolution, 25: 536-548 (2008).
  50. Falcón, L.I., R. Cerritos, L. Eguiarte,  V. Souza. Nitrogen Fixation in Microbial Mat and Stromatolite Communities from Cuatro Cienegas, Mexico. Microbial Ecology, 54: 363-373 (2007).
  51. Douglas B. Rusch1, Aaron L. Halpern1, Karla Heidelberg1, Shannon Williamson1, Shibu Yooseph1, Jonathan Eisen1, Jeff Hoffman1, Charles H. Howard1, Cyrus Foote1, Brooke A. Dill1, Karin Remington1, Karen Beeson1, Bao Tran1, Hamilton Smith1, Cindy Pfannkoch1, Granger Sutton1, John Heidelberg2, Terry Utterback1, Yu-Hui Rogers1, Chris Miller3, Luisa Falcón4, Valeria Souza4, Ken Nealson5, Shubha Sathyendranath6, Trevor Platt6, Eldredge Bermingham7, Victor Gallardo8, Giselle Tamayo9, Robert Friedman1, Marvin Frazier1, Robert Strausberg1, J. Craig Venter1. The Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition: I. Northwest Atlantic through eastern tropical Pacific. PloS Biology, 5: 0398-0431 (2007).
  52. Lesser, MP., Falcón, LI., Rodríguez-Román, A., Enríquez, S., Hoegh-Guldberg, O., Iglesias-Prieto, R. Nitrogen Fixation by symbiotic cyanobacteria provides a new source of nitrogen for the scleractinan coral Montastrea cavernosa. Marine Ecology Progress Series, 346: 143-152 (2007). https://doi.org/10.3354/meps07008
  53. de Wit, R., Falcón, LI., Charpy-Roubaud, C. Heterotrophic dinitrogen fixation (acetylene reduction) in phosphate-fertilised Microcoleus chthonoplastes microbial mat from the hypersaline inland lake la Salada de Chiprana (NE Spain). Hydrobiologia, 534, 245-253 (2005).
  54. Falcón, L. I., S. Pluvinage & E. J. Carpenter. Growth kinetics of marine unicellular N2 fixing cyanobacterial isolates in continuous culture in relation to phosphorus and temperature. Marine Ecology Progress Series, 285: 3-9 (2005).
  55. Falcón, L. I., S. Lindwall, K. Bauer, B. Bergman & E. J. Carpenter. Ultrastructure Analysis of Unicellular N2-fixing Cyanobacteria Isolated from the Tropical North Atlantic and Subtropical North Pacific Oceans. Journal of Phycology, 40: 1074-1078 (2004).
  56. Falcón, L. I., E. J. Carpenter, F. Cipriano, B. Bergman & D. G. Capone. N2-fixation by unicellular bacterioplankton in the Atlantic and Pacific Oceans: phylogeny and in situ rates. Applied and Environmental Microbiology, 70 (2): 765-770 (2004).
  57. Falcón, L. I., F. Cipriano, A. Y. Chistoserdov & E. J. Carpenter. Diversity of Unicellular Diazotrophic Cyanobacteria in the Tropical North Atlantic Ocean. Applied and Environmental Microbiology, 68 (11): 5760-5764 (2002).
  58. Falcón, L. I., Escobar-Briones, E. & Romero, D. Nitrogen fixation patterns displayed by cyanobacterial consortia in Alchichica crater-lake, Mexico. Hydrobiologia, 467 (1): 71-78 (2002).
  59. Falcón, L.I., Vechionne, M. & Roper, C. Paralarval gonatid squids (Cephalopoda: Oegopsida) from the Mid-North Atlantic Ocean. Proceedings of the Biological Society of Washington, 113 (2): 532-541 (2000).
  60. Capítulos de libro

  61. Martínez-Romero J, Falcón LI, Aguirre-Noyola JL, Rosenblueth M, Martínez-Romero E. Microbial symbiosis. Brenner´s Encyclopedia of Genetics, 3rd Edition (2022) Elsevier. doi:10.1016/B978-0-12-822563-9.00038-X

  62. Alcántara-Hernández RJ, TaÅŸ N, Centeno CM*, Valdespino-Castillo PV*, Batista S, Merino-Ibarra M, Campo J, Falcón LI. Bacterial diversity in microbial mats from King George Island, Maritime Antarctica. Pandney A, Sharma A (Editores) (2021) Unique Ecosystems: amazing microbes, Springer. ISBN 9780367350161

  63. Valdespino-Castillo PM*, Águila B, Torres-Huesca J, Centeno CM*, Reyes-Salas M, Angeles-García S, Beltrán Y, Alcántara-Hernández RJ, Holman HY, Falcón LI. Microbialites: Diversity hotspots in the Mexican Plateau. J Alcocer (Editor) (2021) Lake Alchichica Limnology: The uniqueness of a tropical maar lake, Springer. ISBN 978-3-030-79095-0 

  64. Falcón LI**, Valdespino-Castillo MP*, Alcántara-Hernández RJ, Gómez-Acata ES, Yanez-Montalvo A*, Águila B*. Stromatolites in crater-lake Alchichica and Bacalar lagoon. Capítulo 9, Souza, V., Segura A., Foster, J (Editoras) (2020) Astrobiology and Cuatro Ciénegas Basin as an Analog of Early Earth. Springer. ISSN 2523-7292

     

  65. Valdepino-Castillo PM, Alcántara-Hernández RJ, Falcón LI. Microbialitos. Capítulo 15, Alcocer, J. (Editor). 2019. Lago Alchichica: Una joya de biodiversidad. Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Estudios Superiores Iztacala y CONABIO. México. 244 pp. ISBN 978-607-30-2278-1
  66. Bernal-González, M., Toscano-Pérez, D., Falcón, L. I., Alcántara-Hernández, R. J., Salgado-Bernal, I., Solís-Fuentes, J. A., ... & Gaur, R. (2016). Archaea, a useful group for unconventional energy production: methane production from sugarcane secondary distillation effluents using thermotolerant strains. The handbook of microbial bioresources, 502-527. ISBN 9781780645216 178064521X
  67. Hernández-Arana, HA., Vega-Zepeda, A., Ruíz-Zárate., MA., Falcón-Álvarez, LI., López-Adame, H., Herrera-Silveira, J., Kaster, J. Transverse coastal corridor: from freshwater lakes to coral reefs ecosystems. Biodiversity and Conservation of the Yucatan Peninsula, Mexico, Springer New York. Pp. 355-376. ISBN 978-3-319-06529-8 (2015).
  68. Alcocer J, Vilaclara G, Escolero OA, Falcón LI, Valdespino PM, Mazari M. 2015. REPORTE MEXICANO DE CAMBIO CLIMÁTICO, Grupo II, Impactos, Vulnerabilidad y adaptación. Capítulo 2: Aguas Continentales. Pp. 41-56. ISBN: 978-607-02-7370-4 (2015).
  69. Valdespino-Castillo P.M., Alcántara-Hernández R.J., Alcocer J.,Macek M., Merino-Ibarra M., Oseguera L.A., Castillo F.S., Cruz A., Gaona O., Falcón L.I. Diversidad genética de fosfatasas alcalinas para la remineralización de fósforo orgánico disuelto en comunidades microbianas de un lago sódico. En: Alcocer, J., M. Merino-Ibarra, E. Escobar-Briones. (Ed). Tendencias de investigación en Limnología tropical: Perspectivas universitarias en Latinoamérica. Pp. 191-201. Asociación Mexicana de Limnología, A.C. e Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, UNAM. México. ISBN 978-607-02-7199-1 (2015).
  70. Escobar E, Maass M, Alcocer Durand J, Azpra Romero E, Falcón LI, et al. Diversidad de procesos funcionales en los ecosistemas. En Capital Natural de México, vol. 1: Conocimiento actual de la biodiversidad. CONABIO, México, Pp. 161-189. ISBN 978 607 7607 03 8 (2009).
  71. Falcón, LI and Valera A. 2007. Extracción de ácidos nucléicos. En Ecología Molecular. Eguiarte, LE, Souza V y Aguirre X. INE, SEMARNAT, CONABIO, México, Pp. 499-515. ISBN 978 968 817 839 3.
  72. Escobar-Briones E., Falcón, L. I. Sediment oxygen consumption in the south western Gulf of Mexico. Benthic Habitats and Effects of Fishing. American Fisheries Society, Pp. 219-233 (2005). ISBN 1888569603.
  73. Artículos de Divulgación
     
  74. Microbialites: what on Earth? Yanez-Montalvo A, Aguila B, Gómez-Acata ES, Beltrán Y, Valdespino-Castillo PM, Centeno CM, Falcón LI. Frontiers for Young Minds (2019) https://doi.org/10.3389/frym.2019.00112.
  75. Cadena S, Cervantes F, Falcón L and García-Maldonado J (2019) The Role of Microorganisms in the Methane Cycle. Front. Young Minds. 7:133. doi: 10.3389/frym.2019.00133
  76. Novedades, QR. 25 marzo, 2017. “La UNAM lo confirma: la laguna de Bacalar ‘sufre. Entrevista.
  77. Novedades, QR. 7 mayo, 2017. “Laguna de los Siete Colores, en peligro de contaminación. Entrevista.
  78. Novedades, QR. 7 agosto, 2017. “Turistas convierten el Canal de los Piratas en comedor”. Entrevista.
  79. Novedades, QR. 18 mayo, 2017. “Turismo merma el manglar en el Canal de los Piratas”. Entrevista.
  80. Novedades, QR. 6 septiembre, 2017. “Promueven cuidado del Canal de los Piratas”. Entrevista.
  81. Novedades, QR. 2 mayo, 2017. “Realizan censo de estromatolitos en la Laguna de Bacalar. Entrevista.
  82. Novedades, QR. 10 abril, 2017. “¡Urge! Protección de estromatolitos en Bacalar”. Entrevista.
  83. Gaona O y Falcón LI. La microbiota: aliada invaluable- entrevista publicada en El Universal. 9 de diciembre, 2016.
  84. Falcón LI. Hacia la recuperación de cuerpos de agua y arrecifes. Gaceta UNAM, 14 de septiembre, 2016.
  85. Patricia M Valdespino-Castillo, Martín Merino-Ibarra, Víctor M Valdespino, Luisa I Falcón. Es una planta, un animal o …un holobionte? Ciencia y Desarrollo, Julio-Agosto, 6-11 (2014).
  86. Boege, K., A. Córdoba, C. Cordero, C. A. Domínguez, H. Drummond, L. E. Eguiarte, J. Fornoni, LI Falcón, G García, JP Jaramillo, J Nuñez, D Piñero, V        Souza, R Torres. "La ecología evolutiva: interfase de la ecología y la evolución." Ciencias 103 (2011): 28-37.
  87. Souza,Valeria, Luisa I. Falcón, James J. Elser, and Luis E. Eguiarte. "Protecting a window into the ancient Earth: towards a Precambrian park at Cuatro Cienegas, Mexico." The Citizen's Page, Evolutionary Ecology Research (2007).
  88. Luisa I. Falcón, Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. 2005. Microbiologia evolutiva: los estromatolitos de Cuatro Ciénegas. Scientific American Latinoamérica. año 3 num. 32, 30-31. 
  89. Amanda Castillo, Luisa I. Falcón y Valeria Souza. 2005. El mar, el origen y la evolución de la vida. Revista Ciencia y Desarrollo de CONACyT. Septiembre.  51-53.

Tesis Dirigidas

 

Licenciatura

1. Yuriko Ríos, Facultad de Ciencias, UNAM, Biología. Tesis. Filogenia molecular         de caracoles acuáticos Littorinimorpha, Rissooidea e Hydrobiidae con énfasis en la         malacofauna endémica de Cuatro Ciénegas. Coahuila, México. 15 de octubre, 2006.        62 pp.

2. Yislem Beltrán, Facultad de Ciencias, UNAM, Biología. Tesis. Composición y          genealogía de picocianobacterias en las regiones oligotróficas Cuatro Ciénegas,        Coahuila y Canal de Yucatán. 9 de mayo, 2007. 72 pp.

3. Julia Domínguez Escobar, Facultad de Ciencias, UNAM, Biología. Tesis.        Estudios evolutivos y morfológicos de cianobacterias relacionadas a Calothrix. 14 de marzo, 2008. 51 pp.

 

            Maestría

  1. Yislem Beltrán. Posgrado en Ciencias Biológicas, Maestría en Ciencias. Tesis. Estimación de los patrones de fijación de nitrógeno y diversidad asociada (nifH) en tapices microbianos y estromatolitos. 28 de octubre, 2010. 83 pp.
  2. Gerardo I Aguiñaga Torres. Maestría en Ciencias. Tesis. Evaluación de la calidad del compost como subproducto de biodigestores anaerobios. 17 de mayo, 2014. 68 pp.
  3. Octavio Abraham Moreno Guillén. Maestría en Ciencias. Tesis. Análisis de clusters hidrofóbicos (HCA): Un método eficiente y preciso en la determinación de similitud estructural (homología) aun entre proteínas de secuencia divergente. Estudio de caso basado en las Lisozimas y la AMP-Deaminasa. 10 de diciembre, 2014. 88 pp.
  4. Mario Carrillo Araujo. Maestría en Ciencias. Tesis.  Composición de comunidades enterobacterianas en Phyllostomidae. Octubre, 2015.
  5. Jesús Tadeo Martínez Días. Maestría en Ciencias. Tesis. Precipitación de carbonatos en picocianobacterias. Junio, 2018.
  6. Ricardo Mercado Juárez. Maestría en Ciencias. Tesis. Análisis metagenómico de tapices microbianos de la región antártica ‘McMurdo Dry Valleys’. Enero, 2020. Mención honorífica.

 

 

Doctorado

  1. Carla Centeno Ramos. Doctorado en Ciencias. Tesis. Análisis de la diversidad ecológica y filogenética de comunidades de procariontes asociadas a microbialitos de México. 7 de junio, 2013. 132 pp (Puesto actual: Profesora de asignatura, IPN, Escuela de Ciencias Biológicas).
  2. Patricia Margarita Valdespino Castillo. Doctorado en Ciencias. Tesis. Identificación del papel diferencial de componentes de la comunidad bacteriana en el ciclo del P: microbialitos y bacterioplancton del lago cráter Alchichica como modelo de estudio. Abril, 2014 (Puesto actual: Investigadora Postdoctoral LBNL).
  3. Yislem Beltrán. Doctorado en Ciencias. Tesis. Análisis de diversidad funcional de comunidades bacterianas formadoras de estructuras carbonatadas. Mayo, 2017 (Puesto actual: Investigadora postdoctoral, Unidad Académica de Sistemas Arrecifales, UNAM, Puerto Morelos, QR).
  4. Daniel Cerqueda. Doctorado en Ciencias. Tesis. Estudio in silico de la complementación metabólica de una comunidad de microbialitos: un enfoque funcional en un caso de estudio altamente estructurado. Octubre, 2017. (Puesto actual: Investigador postdoctoral, CINVESTAV, Mérida, Yuc).
  5. Osiris Gaona Pineda. Doctorado en Ciencias (Posgrado en Ciencias Biológicas). Tesis. Dinámica del microbioma en los diferentes estadíos reproductivos de dos poblaciones de Leptonycteris yerbabuenae. (Puesto actual: Técnico académico, UNAM, Instituto de Ecología).
  6. Alfredo Yanez Montalvo. Doctorado en Ciencias (Doctorado en Ciencias en Ecología y Desarrollo Sustentable, ECOSUR). Tesis. Bioprospección de cianobacterias asociadas a microbialitos de la Laguna de Bacalar, Quintana Roo. Septiembre, 2020. (Puesto actual: Investigadora postdoctoral, ITZM, Chetumal). SNI I.

  7. Andrés Sánchez Quinto. Doctorado en Ciencias (Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología). Tesis. Análisis metagenómico y ecofisiológico de biofilms colonizadores de sustratos coralinos. Septiembre, 2020. (Puesto actual: Investigador postdoctoral, SDSU).

  8. Bernardo Aguila Salgado. Doctorado en Ciencias (Posgrado en Ciencias Biológicas) Tesis. Análisis comparativo y funcional de cianobacterias asociadas a la formación de microbialitas de la Laguna Bacalar y del Lago Alchichica. Noviembre, 2022. Mención honorífica. (Puesto actual: Investigador postdoctoral Instituto de Biología, UNAM).

 

En proceso:

Maestría

  1. Luis Alejandro Alejandro Castro. Maestría en ciencias (posgrado en Ciencias del Mar y Limnología) Tesis. Efecto del hidroperiodo sobre la composición microbiana y contenido de carbono de sedimento de bosques de Rhizophora mangle chaparro, en Celestún, Yucatán.

 

Doctorado

 

  1. Ricardo A Mercado Juárez. Doctorado en Ciencias (Posgrado en Ciencias Biológicas) Tesis. Metagenómica de tapetes microbianos de Antártida. 

  2. Daniel Esguerra.  Doctorado en Ciencias (Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología) Tesis. Ecología microbiana de bosques de manglar.

           

Asesoría postdoctoral

  1. Rocío J Alcántara Hernández. Becaria posdoctoral, CONACyT. Septiembre 2012-2013. Proyecto. Expresión génica asociada al ciclo del N bajo escenarios de cambio climático usando como modelo las comunidades bacterianas del lago cráter Alchichica (Puesto actual: Investigadora Titular A de TC, Instituto de Geología, UNAM).
  2. E. Selene Gómez Acata. Becaria postdoctoral UNAM. Octubre 2017-2019.
  3. Claudia Teutli. Vecería postdoctoral PAPIIT. Enero-Diciembre, 2021.

  4. Arit de León. Becaria postdoctoral CONACyT. Enero, 2021-2022.

  5. Alfredo Yanez. Becario postdoctoral PAPIIT. Enero-Diciembre, 2022.

  6. María Fernanda Sánchez-Soto. Becaria postdoctoral PAPIIT. Enero-Diciembre, 2023; becaria CONAHCyT 2024-

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