Líneas de Investigación / Líneas de Trabajo

 

  • Ecología molecular microbiana 
  • Ciencia y género

 

Formación Académica

Tesis de Doctorado

Ecología molecular microbiana: estudios de comunidades y biogeografía en sistemas acuáticos
Posgrado en Ciencias Biomédicas, Mayo del 2015
Asesora de tesis: Dra. Valeria Souza Saldivar.

Tesis de Maestría

Análisis de la diversidad de procariontes usando el gen 16S ribosomal: origen marino de la región de Cuatro Ciénegas Coahuila.
Maestría en Investigación Biomédica Básica. Marzo, 2005.
Asesora de tesis: Dra. Valeria Souza Saldívar.

Tesis de Licenciatura

Análisis molecular del sistema ABO.
Licenciatura en Investigación Biomédica Básica. Noviembre, 1996.
Asesor de tesis: Dr. Alejandro García Carrancá.

Experiencia profesonal

  • 2020. Cambio de adscripción a la Dirección del Instituto de Ecología (provisionalmente), para encargarse de asesorar y trabajar temas de igualdad y violencia por razones de género. 
  • Contrato como Técnica Académica en el Instituto de Ecología de la UNAM, a partir del 25 de agosto del 2005. Se estandarizaron técnicas que han permitido la caracterización de comunidades bacterianas: TRFLPs (Terminal Restriction Fragment Lenght Polimorfisms) y CARD-FISH, además de extracción de ADN ambiental, así como técnicas y análisis relacionados con NGS.
  • Asesoría técnica en biología molecular para el proyecto “Evolution in microbe-based ecosystems”, financiado por la NASA de Enero del 2001 a Enero 2005. Con el fin de caracterizar comunidades bacterianas se estandarizó la técnica de extracción de ADN, así como clonación y secuenciación del gen 16S ribosomal para comunidades bacterianas en agua, utilizando y manejando el equipo de secuenciación adquirido en el laboratorio.
  • Asesoría técnica en biología molecular para el laboratorio de evolución molecular y experimental del Instituto de Ecología, UNAM, de Enero del 2000 a Enero del 2001. En este periodo se montó en el laboratorio distintos tipos de PCR (16S ribosomal, eaeA, Tir), se estandarizó la técnica de southern blott con DIG-oxigenina para caracterizar cepas de E.coli y se asesoró en la extracción de ADN de cactáceas de la doctrora Mandujano.
  • Técnica académica en el proyecto “efecto de las cepas de Rizhobium etli en la productividad del frijol (phaseolus vulgaris) en México, financiado por la empresa “Fertilizantes Fluidos SA de CV, de Enero 1999 a Enero 2000. Montaje de la técnica PFGE (Pulsed Field Gel Electroforesis) para separación de plásmidos y fragmentos de ADN de alto peso molecular con fines de caracterización de las cepas.

Premios y Distinciones

  • SNI I desde enero del 2022
  • Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz UNAM en 2020
  • Conmemoración XV años de labores en la UNAM en 2020.
  • PRIDE nivel D, desde agosto 2017
  • 1er lugar del premio patrocinado por Distribuidora Química Integral, al trabajo libre presentado en el 34 Congreso Nacional de Microbiología, otorgado por la Asociación Mexicana de Microbiología, A.C. el 29 de agosto del 2004.
  • Mención honorífica “Faustino Miranda” en la presentación en cartel durante el II Simposio Estudiantil “Regeneración Intelectual de la Ecología”, otorgada por el Instituto de Ecología el 19 de noviembre del 2003.
  • Medalla Gabino Barreda al más alto promedio de calificación, otorgada por la UNAM el 18 de agosto de 1997.
  • Mención honorífica en el examen profesional del 15 de noviembre de 1996, otorgada por la UNAM el 9 de enero de 1997.

Proyecto PAPIIT IA400223 “Sesgos androcéntricos en el sistema de evaluación de plazas académicas UNAM, para una reformulación desde la interdisciplina”. Corresponsable (responsable: Dra. lu ciccia, CIEG, UNAM).

Hidrocomunidades, proyecto interdisciplinario que involucra arte, ciencia y divulgación, en colaboración con Gilberto Esparza (https://www.youtube.com/watch?v=YpUhpe_U4ak) (https://bit.ly/35DqGML)

 

Artículos científicos

  1. Favila N., Madrigal-Trejo D., Legorreta D., Sánchez-Pérez J., Espinosa-Asuar L., Eguiarte L. E., Souza V. (2022) MicNet toolbox: Visualizing and unraveling a microbial network.  PLoS One. 17(6):e0259756. doi: 10.1371/journal.pone.0259756
  2. Espinosa-Asuar L., Monroy C., Madrigal-Trejo D., Navarro-Miranda M., Sánchez-Pérez J., Muñoz J., Diego Villar J., Cifuentes J., Kalambokidis M., Esquivel-Hernandez D.A, Viladomat M, Escalante-Hernández A.E., Velez P., Figueroa M., Martínez-Cárdenas A., Ramirez Barahona S., Gasca-Pineda J., Eguiarte L.E., Souza V. (2022). Diversity of an uncommon elastic hypersaline microbial mat along a small-scale transect. PeerJ 10:e13579 https://doi.org/10.7717/peerj.13579 
  3. García-Ulloa M., Souza V, Esquivel-Hernandez D., Sánchez-Pérez J., Espinosa-Asuar L., Viladomat M., Marroquín-Rodriguez M., Navarro-Miranda M., Ruiz-Padilla J., Monroy-Guzmán C., Madrigal-Trejo D., Rosas-Barrera M., Vázquez M. & Eguiarte L.E.(2022) Recent differentiation of aquatic bacterial communities in a hydrological system in the Cuatro Ciénegas Basin, after a natural perturbation. Frontiers in Microbiology.
  4. Velez P., Salcedo D.L, Espinosa-Asuar L., Gasca-Pineda J., Hernandez-Monroy A., Soto L.A. (2022) Fungal diversity in sediments from deep-sea extreme ecosystems in the southern Gulf of California, Mexico: Insights into low- and high-temperature hydrothermal vents, and oxygen minimum zones. Frontiers in Marine Scienc
  5. Ojeda, M., Vélez, P., Espinosa-Asuar, L., Eguiarte, L.E.  & Souza, V. (2020). New species of Trhypochthoniellus (Acari: Oribatida: Trhypochthoniidae) from Cuatro Ciénegas, Coahuila, México with remarks on feeding habits. Systematic and Applied Acarology 25(6): 974-985 
  6. Velez.P., Ojeda M., Espinosa-Asuar L., Pérez T. M., Eguiarte L.E., & Souza V.. (2018). Experimental and molecular approximation to microbial niche: trophic interactions between oribatid mites and microfungi in a oligotrophic freshwater system. Peer J doi:http://dx.doi.org/10.7717/peerj.5200 
  7. Velez P., Espinosa-Asuar L., Figueroa M., Gasca-Pineda J., Aguirre-von-Wobeser E., Eguiarte L.E, Hernandez-Monroy A., Souza V. (2018). Nutrient dependent cross-kingdom interactions: Microfungi and bacteria from an oligotrophic desert oasis. Frontiers Microbiology: 9:1755
  8. Velez P, Gasca-Pineda J, Rosique-Gil E, Eguiarte LE, Espinosa-Asuar L, Souza V*. 2016. Microfungal oasis in an oligotrophic desert: diversity patterns and community structure in three freshwater systems of Cuatro Ciénegas, Mexico. PeerJ e2064 doi: 10.7717/peerj.2064
  9. Espinosa-Asuar, L., Escalante, A.E., Gasca-Pineda, J., Blaz, J., Peña, L., Eguiarte, L. E. & Souza, V. (2015) Aquatic bacterial assemblage structure in Pozas Azules, Cuatro Ciénegas Basin in México: deterministic vs. stochastic processes. International Microbiology 18:105-115. doi: 10.2436/20.1501.01.240 
  10. Espinosa-Asuar, L., Escalante, A.E., Falcón, L.I., Bonilla-Rosso, G., Ramírez-Barahona, S., Eguiarte, L.E. & Souza V. (2014) Comparación de tres métodos moleculares para el análisis de procariontes ambientales en el mar del canal de Yucatán. Hidrobiológica 24: 167-179. 
  11. Falcón, L.F., Noguez, A.M., Espinosa-Asuar, L., Eguiarte, L.E. & Souza V. (2008) Evidence of biogeography in surface ocean bacterioplankton assemblages. Marine Genomics 1:55-61. http://doi.org/10.1016/j.margen.2008.06.005 
  12. Escalante, A.E., Eguiarte, L.E., Espinosa-Asuar, L., Forney, L.J., Noguez, A.M & Souza, V. (2008) Diversity of aquatic prokaryotic communities in the Cuatro Ciénegas basin. FEMS Microbiology Ecology 65: 50-60. doi: 10.1111/j.1574-6941.2008.00496.x 
  13. Souza, V., Espinosa-Asuar, L., Escalante, A.E, Eguiarte, L.E, Farmer, J., Forney, L., Lloret, L., Rodríguez-Martínez, J.M., Soberón, X., Dirzo, R. & Elser, J.J. (2006) An endangered oasis of aquatic microbial biodiversity in the Chihuahuan desert. PNAS 103 (17): 6565-6570. doi: 10.1073/pnas.0601434103 

Libros o capítulos de libros

  1. Espinosa-Asuar L., Soto L.A., Salcedo D., Hernández-Monroy A., Eguiarte L.E., Souza V., Vélez P. 2020 Bacterial communities from deep-hydrothermal systems: the southern Gulf of California as an example of primeval environments. In: Souza V., Eguiarte L. (eds) Cuatro Ciénegas Astrobiology. Springer, Cham. 
  2. Souza V., Rebollar E., López-Lozano E., Avitia M., Espinosa-Asuar L. y Eguiarte L.E. Diversidad microbiana en Cuatro Ciénegas, Coahuila. 2019. En: Javier Álvarez Sánchez, Pilar Rodríguez Guzmán y Alejandro Alarcón (Coordinadores). Biodiversidad de Microorganismos de México. Importancia, Aplicación y Conservación. 1a. Ed. Electrónica. D.R. UNAM. ISBN 978-607-30-1596-7
  3. Souza V., Equihua C. Espinosa-Asuar L. y Eguiarte L. E. 2019. Biología para 5to de preparatoria. Grupo MacMillan. México D.F.
  4. Vélez P., Espinosa-Asuar L., Travisano M., Eguiarte L.E., Souza V. 2018 The Niche at the Edge of Life or the Microbial Ecology (Including Microfungi) of Cuatro Ciénegas: Mutualisms with Locals, Antagonisms Against Foreigners. In: Souza V., Olmedo-Álvarez G., Eguiarte L. (eds) Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Cuatro Ciénegas Basin: An Endangered Hyperdiverse Oasis. Springer, Cham. 
  5. Souza V., Equihua C. Espinosa-Asuar L. y Eguiarte L. E. 2013. Biología para 5to de preparatoria. Grupo MacMillan. México D.F.
  6. Espinosa Asuar Laura. 2007. Guía práctica sobre la técnica dePCR. En: L. E. Eguiarte, V. Souza y X. Aguirre (ed) Ecología molecular. INE, CONABIO y UNAM.
  7. Souza V., A. Escalante., A. Noguez., L. Espinosa-Asuar, R. Cerritos y L. Eguiarte. 2004. La ecología microbiana: una nueva ciencia para un nuevo siglo. En: I. Rosas, A. Cravioto y E. Ezcurra (ed.) Microbiología Ambiental. UNAM.

Artículos de divulgación

  1. Carolina Casillas, Laura Espinosa Asuar y Patricia Vélez. El halo infinito de la química: los hongos del suelo y los ciclos biogeoquímicos. Diciembre 2021. Oikos= Núm. 23 en línea 
  2. Lakshmi Charli Joseph, Laura Espinosa Asuar, Clementina Equihua y Luis E. Eguiarte. De los editores. Las ciencias de la sostenibilidad. Enero 2019. Oikos = Núm 22 en línea.
  3. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua, Laura Espinosa Asuar y Esmeralda Osejo Britto. De los editores. Este 2018 celebramos a las aves. Noviembre 2018. Oikos = Núm 21 pág 6-7.
  4. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. ¿Áreas protegidas para qué? Mayo 2018. Oikos = Núm 20 pág. 6.
  5. Laura Espinosa Asuar y Alejandro Araujo. Biogeoquímica en Cuatro Ciénegas: mundos dentro de mundos y miradas a escala. Diciembre 2017. Oikos = Núm 19 pág. 14-16.
  6. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. Ecólogos, conservación y reservas ecológicas. Diciembre 2017. Oikos = Núm 19 pág. 7.
  7. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. Agaves, agaves y más agaves. Septiembre 2017. Oikos = Núm 18 pág. 7.
  8. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. La milpa es un espejo de la diversidad biológica y cultural de México. Marzo 2017. Oikos = Núm 17 pág. 7.
  9. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. La tabla Periódica de la vida. Agosto 2016. Oikos = Núm 16 pág. 7.
  10. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. México en el Antropoceno. Diciembre 2015. Oikos = Núm 15 pág. 4.
  11. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. De la ecología de los ecólogos al Posgrado en Ciencias de la Sostenibilidad. Agosto 2015. Oikos = Núm 14 pág. 4.
  12. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. Ecología y geografía: de los naturalistas del siglo XIX a la geomática. Febrero 2015. Oikos = Núm 13 pág. 4.
  13. Luis E. Eguiarte, Clementina Equihua y Laura Espinosa Asuar. De los editores. CAS: la trenza de la conservación, reservas y el impacto de la obra del Dr. José Sarukhán. Agosto 2014. Oikos = Núm 12 pág. 4.
  14. Souza V., Espinosa-Asuar L. (2007) Cuatro Ciénegas, un ecosistema para entender el pasado, en peligro de extinción. Especies, revista sobre conservación y biodiversidad. Marzo-Abril: 16-22.
  15. Espinosa A., Escalante A. Eguiarte L y Souza V. (2005) El mar en el desierto y su importancia para la conservación. Biodiversitas. 58: 7-11.
  16. Souza V., Escalante A., Espinosa L., García Pichel F., Elser F., Valera A., Cruz A. y Eguiarte L.E. (2004) Los microbios de Cuatro Ciénegas: un laboratorio natural para el estudio de la Astrobiología. Ciencias, revista de difusión. 75: 4-12.
  • Jesica Abril Hernández Monroy (2019) Diversidad microbiana cultivable e interacciones ecológicas entre bacterias y hongos de ventilas hidrotermales y fondo marino del Sur del Golfo de California, México. Tesis para obtener el título de Bióloga. Instituto de Biología/Instituto de Ecología, UNAM. Fecha de examen: 3 de diciembre 2019.
  • Carlos José Moreno Fontalba (2016) Ecología de las interacciones entre bacterias en Cuatro Ciénegas, Coahuila, México. Trabajo de fin de Master para obtener el título de Master universitario en biología avanzada. Universidad de Sevilla, España. Facultad de Biología. Fecha de examen: 20 de septiembre del 2016.
  • Jazmin L. Blaz Sánchez (2014) Análisis de la distribución y diversidad de las  comunidades bacterianas en Pozas Azules, Cuatro Ciénegas, usando el gen que codifica el 16S de ARNr. Tesis para obtener el título de Bióloga. Instituto de Ecología, UNAM. Fecha de examen: 17 sept 2014.
  • Blanca Lorena Peña García (2014). Distribución y diversidad del phylum Planctomycetes en Pozas Azules, Cuatro Ciénegas, utilizando el gen que codifica para 16S ARNr. Tesis para obtener el título de Bióloga. Instituto de Ecología, UNAM. Fecha de examen: 28 oct 2014.