Líneas de Investigación

Los mecanismos evolutivos y ecológicos que generan la diversidad y la adaptación y desarrollar propuestas para conservar esta biodiversidad.

 

Nuestro proyecto más importante es sobre el género Cucurbita, las calabazas, analizando desde sus genomas y su domesticación hasta sus recursos genéticos y su conservación.

 

En plantas, tradicionalmente hemos trabajado con los agaves, con parientes silvestres de plantas cultivadas como Zea (teosinte y maíz), y en el estudio de plantas del desierto.

 

En animales, nuestro interés principal es mamíferos, especialmente murciélagos nectarívoros, en particular el género Leptonycteris, y en aves colibríes y la evolución de la nectarivoría.

Con bacterias themos trabajado con grupos como Escherichia coli, Rhizobium, Vibrio, Bacillus, Pseudomonas y con las bacterias de Cuatro Cienégas.

Formación Académica

Posdoctorado:

Associate Researcher.

Department of Botany and Plant Sciences, University of California at Riverside, Estados Unidos.

1990- 1992.

Asesor: Dr. Michael T. Clegg

 

Doctorado:

Doctor en Ecología.

Centro de Ecología, UNAM, México.

1985-1990.

Tesis de Doctorado: Genética de poblaciones de Astrocaryum mexicanum Liebm. en Los Tuxtlas, Veracruz.

Director de Tesis: Dr. Daniel Piñero.

Mención Honorífica a la Tesis Doctoral 

 

 

Licenciatura:

Biología.

Facultad de Ciencias, UNAM, México.

1979-1983.

Tesis licenciatura: Biología floral de Manfreda brachystachya (Cav.) Rose en el Pedregal de San Angel México, D.F..

Director de tesis: Dr. José Alberto Búrquez Montijo.

Experiencia profesonal

Visiting researcher (sabático), Department of Plant and Microbial Biology, University of Minnesota, St. Paul, MN, EUA, 2017 - 2018.

 

Jefe de Departamento, Ecología Evolutiva, Instituto de Ecología, UNAM, México, 2011 -2013.

 

Visiting researcher (sabático), Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California at Irvine, EUA, 2009 - 2010.

 

Investigador Titular “C” de tiempo completo definitivo, Instituto de Ecología, UNAM, México, 2002 a la fecha.

 

Jefe de Departamento, Ecología Evolutiva, Instituto de Ecología, UNAM, México, 2001 al 28 de febrero - 2005.

 

Visiting researcher (sabático), Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California at Irvine, EUA 1999 - 2000.

 

Investigador Titular “B” de tiempo completo definitivo, Centro de Ecología/Instituto de Ecología, UNAM, México, 1995 - 2002.

 

Investigador Titular "A" de tiempo completo, Centro de Ecología, C.U., UNAM, México, 1992 -1995.

 

Investigador asociado "C" de tiempo completo, Centro de Ecología, C.U., UNAM, México, 1990.

 

Técnico académico asociado “A” de tiempo completo, proyecto "Evolución y genética del frijol (Phaseolus spp.)", a cargo del Dr. Daniel Piñero, departamento de Ecología del Instituto de Biología, C.U., UNAM, México, 1984 -1986.

Premios y Distinciones

Miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI): Nivel III del 2006 a la fecha, renovado de 2012 al 2016, y de 2017 al 2026; Nivel II, del 1999 al 2006; Nivel I de 1990 al 1999;

Estímulos Pride, UNAM, Nivel Nivel D, desde 2003, renovado 2008, renovado 2013, renovado 2018.

Medalla Faustino Miranda en reconocimiento a su contribución académica en la Ecología, Instituto de Ecología, UNAM, 25 de abril del 2011.

Mención Honorífica del Premio al Mérito Ecológico 2014, 5 de junio 2014, SEMARNAT.

Vicepresidente, Sociedad Científica Mexicana de Ecología, del 2016 al 2018.

Medalla Gabino Barreda al mejor promedio de la generación, doctorado en Ecología.

Segundo lugar, certamen de Tesis de Posgrado en Botánica "Efraím Hernández Xolocotzi" 1990, Colegio de Postgraduados, Chapingo, México.

Mención Honorífica a la Tesis Doctoral.

Diploma por haberse distinguido entre los tres primeros lugares de Biólogo, generación 1979‑1982, Facultad de Ciencias, C.U., UNAM.

 

CUCURBITA:

El proyecto con plantas más activo e importante del Laboratorio de Evolución Molecular y Experimental es sobre la biología evolutiva de las calabazas, el género Cucurbita.

Estamos trabajando con todas las especies del género, especialmente las cultivadas y sus parientes silvestres cercanos.

Nuestros estudios son tanto genómicos, como de filogeografía y evolución molecular, sobre domesticación, recursos genéticos, distribución, filogenia y reloj molecular del género.  

El proyecto es financiando por la CONABIO, y se realiza en colaboración con el Dr. Rafael Lira de la UBIPRO, FES-Iztacala, y el Dr. Salvador Montes, del INIFAP-Celaya.

 

GENOMICA EVOLUTIVA DE VERTEBRADOS:

Otros proyecto importante y activo en el laboratorio es sobre la genómica comparada de murciélago nectarívoros, especialmente del género Leptonycteris y de los colibríes y otras aves nectarívoras. También estamos trabajando con la filogeografía y evolución molecular de las tres especies de Leptonycteris, y fue financiado pro un proyecto de Fronteras de la Ciencia, del CONACyT, 2015, número 17. Un colaborador importante del proyecto es el Dr. Carlos Martínez del Río, de la Universidad de Wyoming, EUA.  http://www.uwyo.edu/cmdelrio/site/welcome.html

 

CUATRO CIENEGAS:

Con bacterias, continuamos con el proyecto PAPIIT Clave: IG200319. Cómo explicar la permanencia de linajes marinos ancestrales en Cuatro Ciénegas: ¿Existe la retroalimentación eco-evolutiva en los tapetes microbianos "Domos del Arqueano"? Cuyo responsable es Valeria Souza Saldivar.

 

ECOLOGIA EVOLUTIVA DE PLANTAS DE MEXICO;

También seguimos analizando y publicando estudios con otras especies de plantas de México, como el género Agave y sus parientes, otras plantas de zonas áridas y semiáridas y con el teosinte y el maíz y los chiles.

GOOGLE SCHOLAR

Para encontrar la lista actualizada de mis artículos y capítulos en libros, recomiendo usar a Google Scholar, dado que se actualiza automáticamente y la mantengo bien curada:

https://scholar.google.com.mx/citations?user=rddAc6cAAAAJ&hl=es

RESEARCH GATE

También pueden revisar mis artículos y otros datos en Research Gate:

https://www.researchgate.net/profile/Luis_Eguiarte/research

 

A continuación anexo la lista de algunas de mis publicaciones asociadas a los proyectos activos en nuestro laboratorio:

 

CALABAZA

Con el género Cucurbita y el proyecto CONABIO, tenemos las siguientes publicaciones:

Helena S. Hernández-Rosales, Gabriela Castellanos-Morales, Guillermo Sánchez de la Vega, Erika Aguirre-Planter, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2020.  Phylogeographic and population genetic analyses of Cucurbita moschata reveal a domestication in Mesoamerica and divergence of two mitochondrial linages linked to an elevational gradient.  American Journal of Botany.107(3): 1–16.doi:10.1002/ajb2.1424FI 2.841

Xitlali Aguirre-Dugua, Gabriela Castellanos-Morales, Leslie M. Paredes-Torres, Helena S. Hernández-Rosales, Josué Barrera-Redondo, Guillermo Sánchez-de la Vega, Fernando Tapia-Aguirre, Karen Y. Ruiz-Mondragón, Enrique Scheinvar, Paulina Hernández, Erika Aguirre-Planter, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2019. Evolutionary dynamics of transferred sequences between organellar genomes in Cucurbita. Journal of Molecular Evolution. 87:327–342. https://doi.org/10.1007/s00239-019-09916-1

Gabriela Castellanos-Morales, Karen Y. Ruíz-Mondragón, Helena S. Hernández-Rosales, Guillermo Sánchez-de la Vega, Erika Aguirre-Planter, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2019. Tracing back the origin of pumpkins (Cucurbita pepo ssp. pepo L.) in Mexico. Proceedings of the Royal Society B 286: 20191440, 9 pages. http://dx.doi.org/10.1098/rspb.2019.1440.

Josué Barrera-Redondo, Enrique Ibarra-Laclette, Alejandra Vázquez-Lobo, Yocelyn T. Gutierrez-Guerrero, Guillermo Sánchez de la Vega, Daniel Piñero, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2019. The genome of Cucurbita argyrosperma (silver-seed gourd) reveals faster rates of protein-coding gene and long noncoding RNA turnover and neofunctionalization within Cucurbita. Molecular Plant,. https://doi.org/10.1016/j.molp.2018.12.023.

Luis E. Eguiarte, Helena S. Hernández-Rosales, Josué Barrera-Redondo, Gabriela Castellanos-Morales, Leslie M. Paredes-Torres, Guillermo Sánchez de la Vega, Karen Y. Ruíz Mondragón, Alejandra Vázquez Lobo, Salvador Montes-Hernández, Erika Aguirre-Planter, Valeria Souza, Rafael Lira.  2018. Domesticación, diversidad y recursos genéticos y genómicos de México: El caso de las calabazas. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 21(Supl. 2): 85-101. DOI: 10.22201/fesz.23958723e.2018.0.159

Gabriela Castellanos-Morales, Leslie Paredes, Niza Gámez, Helena S. Hernández-Rosales, Guillermo Sánchez de la Vega, Josué Barrera-Redondo, Erika Aguirre-Planter, Alejandra Vázquez-Lobo, Salvador Montes, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2018. Historical biogeography and phylogeny of Cucurbita: insights from ancestral area reconstruction and niche evolution. Molecular Phylogenetics and Evolution 128:38-54. FI 4.412. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.07.016

Guillermo Sanchez de la Vega, Gabriela Castellanos-Morales, Niza Gámez, Helena S. Hernández-Rosales, Alejandra Vázquez-Lobo, Erika Aguirre-Planter,  Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2018. Genetic resources in the “calabaza pipiana” pumpkin (Cucurbita argyrosperma) in Mexico: Genetic diversity, genetic differentiation and distribution models. Frontiers in Plant Science. Volume 9 | Article 400, 18 págs. https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00400

Rafael Lira, Luis E. Eguiarte, Salvador Montes, Daniel Zizumbo-Villarreal, Patricia Colunga-García Marín, Mauricio Quesada (2016).  Homo sapiens-Cucurbita interaction in Mesoamerica: Domestication, Dissemination and Diversification. In Lira, Rafael, Casas, Alejandro, Blancas, José (Eds.). Ethnobotany of Mexico: Interactions of People and Plants in Mesoamerica, pp. 389-401. Springer New York, 2016. ISBN 978-1-4614-6668-0. pp. 389-401. 560 págs.

Montes-Hernandez S., Merrick L.C., Eguiarte L.E. (2005) Maintenance of squash (Cucurbita spp.) landrace diversity by farmers' activities in Mexico. Genetic Resources and Crop Evolution 52 (6): 697-707.

Montes-Hernández, S. y L.E. Eguiarte (2002) Genetic structure and indirect estimates of gene flow in three taxa of Cucurbita in Western Mexico.  American Journal of Botany 89: 1156-1163.

 

ECOLOGÍA EVOLUTIVA DEL TEOSINTE (MAÍZ SILVESTRE) Y DOMESTICACIÓN DEL MAÍZ.

Alejandra Moreno-Letelier, J.A. Aguirre-Liguori, Daniel Piñero, Alejandra Vázquez-Lobo, Luis E. Eguiarte. 2020. The importance of gene-flow with wild relatives in understanding the domestication process: the example of maize. Royal Society Open Science. In press.

Aguirre-Liguori Jonás A, Ramírez-Barahona Santiago, Tiffin, P., Eguiarte Luis E. 2019. Climate change is predicted to disrupt patterns of local adaptation in wild and cultivated maize. Procc. Royal Society B 286: 20190486. https://royalsocietypublishing.org/doi/pdf/10.1098/rspb.2019.0486

M-A. Fustier, N.E. Martínez-Ainsworth, A. Venon, H. Corti, A. Rousselet, F. Dumas, H. Dittberner, J.A. Aguirre-Liguori, M.G. Camarena, D. Grimanelli, M. Falque, L. Moreau, J. de Meaux, S. Montes, L.E. Eguiarte, Y. Vigouroux, D. Manicacci, M.I. Tenaillon.. 2019. Common gardens in teosintes reveal the establishment of a syndrome of adaptation to altitude. e1008512. https://doi. org/10.1371/journal.pgen.1008512

Jonás A. Aguirre-Liguori, Brandon S. Gaut, Juan Pablo Jaramillo-Correa, Maud I. Tenaillon, Salvador Montes-Hernández, Felipe García-Oliva, Sarah Hearne, Luis E. Eguiarte. 2019. Divergence with gene flow is driven by local adaptation to temperature and soil phosphorus concentration in teosinte subspecies (Zea mays parviglumis and Zea mays mexicana). Molecular Ecology, 28: 2814–2830. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/mec.15098

M.-A. Fustier, J.T Brandenburg, S. Boitard, J. Lapeyronnie, L.E. Eguiarte, Y. Vigouroux, D. Manicacci, M.I Tenaillon. 2017. Signatures of local adaptation in lowland and highland teosintes from whole-genome sequencing of pooled samples. Molecular Ecology 26: 2738–2756. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/mec.14082

Jonás A. Aguirre-Liguori, Maud I. Tenaillon, Alejandra Vázquez-Lobo, Brandon S. Gaut, Juan Pablo Jaramillo-Correa, Salvador Montes, Valeria Souza, Luis E. Eguiarte. 2017. Connecting genomic patterns of local adaptation and niche suitability in teosintes. Molecular Ecology. 26 (16): 4226–4240. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/mec.14203

María Clara Arteaga, Alejandra Moreno-Letelier, Alicia Mastretta-Yanes, Alejandra Vázquez-Lobo, Alejandra Breña Ochoa, Andrés Moreno, Luis E. Eguiarte and Daniel Piñero. 2016. Genomic variation in recently collected maize landraces from Mexico. Genomics Data 7: 38-45. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213596015300714

Jonás Andrés Aguirre Liguori, Erika Aguirre Planter, Luis E. Eguiarte (2016) Genetics and ecology of wild and cultivated maize: domestication and introgression. In Lira, Rafael, Casas, Alejandro, Blancas, José (Eds.). Ethnobotany of Mexico: Interactions of People and Plants in Mesoamerica. Springer New York, 2016.

https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-1-4614-6669-7_16

Concepción M. Díez, Brandon S. Gaut, Esteban Meca, Enrique Scheinvar, Salvador Montes-Hernández, Luis E. Eguiarte and Maud I. Tenaillon. 2013. Genome size variation in wild and cultivated maize along altitudinal gradients. New Phytologist 199, (1): 264–276. https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/nph.12247

Eguiarte, Luis E., Jonás A. Aguirre-Liguori, Lev Jardón-Barbolla, Erika Aguirre-Planter y Valeria Souza. 2013. Genómica de poblaciones: nada en evolución va a tener sentido si no es a la luz de la genómica, y nada en genómica tendrá sentido si no es a la luz de la evolución. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 16(1):42-56. https://www.medigraphic.com/cgi-bin/new/resumen.cgi?IDARTICULO=42709

Hufford Matthew B., Enrique Martinez-Meyer, Brandon S. Gaut, Luis E. Eguiarte, Maud I. Tenaillon. 2012. Inferences from the Historical Distribution of Wild and Domesticated Maize Provide Ecological and Evolutionary Insight. Plos One, 7 (11) e47659. https://journals.plos.org/plosone/article/file?type=printable&id=10.1371/journal.pone.0047659

Van Heerwaarden, Joost; Ross-Ibarra, Jeffrey; Doebley, John; Glaubitz, Jeffrey; Sánchez González, Jose de Jesús; Gaut, Brandon; Eguiarte, Luis. 2010  Fine scale genetic structure in the wild ancestor of maize (Zea mays ssp. parviglumis). Molecular Ecology 19: 1162–1173. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/j.1365-294X.2010.04559.x

 

ECOLOGÍA EVOLUTIVA DE CUATRO CIÉNEGAS (63 publicaciones hasta marzo 2020)

  1. Jordan G. Okie, Amisha T. Poret-Peterson, Zarraz M.P. Lee  Alexander Richter, Luis D.  Alcaraz, Luis E. Eguiarte, Janet L. Siefert, Valeria Souza  Chris L. Dupont, James J. Elser. 2020. Genomic adaptations in information processing underpin trophic strategy in a whole-ecosystem nutrient experiment eLIFE, 2020;9:e49816. https://doi.org/10.7554/eLife.49816.
  2. Mandujano, María C., Irene Pisanty,  L. E. Eguiarte (eds.) Plant diversity and Ecology in the Chihuahuan desert: Emphasis on the Cuatro Ciénegas Basin.Vol. 4. Cuatro Ciénegas Basin: An endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG. Cham, Switzerland, 19 chapters.  ISBN 978-3-030-44962-9.In press.
  3. Valeria Souza, Gabriela Olmedo-Alvarez y Luis E. Eguiarte. 2019. Cuatrociénegas: un oasis en peligro de extinción. Pp. 64-68. En R. B. Primack y Omar Vida. Introducción a la biología de la conservación. Fondo de Cultura Económica. Ciudad de México, Mexico,  ISBN: 978-607-16-6411-2. 613 páginas 
  4. Valeria Souza, Eria Rebollar, Germán Bonilla-Rosso, Laura Espinosa-Asuar, Nguyen E. López Lozano, Morena Avitia, Andréa González y Luis E. Eguiarte. 2019 ¿Porqué hay tantas especies de microbios? En Francisco Javier Álvarez Sánchez, Pilar Rodríguez Guzmán y Alejandro Alarcón (Coordinadores). Biodiversidad de Microorganismos de México. Importancia, Aplicación y Conservación. 1a. Ed. Electrónica. 2019. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México. Págs. 9-32. ISBN 978-607-30-1596-7.
  5. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco, Jazmín Blaz,Augusto Cesar Poot-Hernández, Bruno Contreras Moreira, Marcos González Laffitte, Niza Gámez Tamariz, Maribel Hernández, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza. 2018. Understanding the Mechanisms Behind the Response to Environmental Perturbation in Microbial Mats: A Metagenomic-Network Based Approach. Frontiers in Microbiology. 9: 2606. doi: 10.3389/fmicb.2018.02606.
  6. V. Souza, A. Moreno-Letelier, M. Travisano, L. D. Alcaraz, G. Olmedo-Alvarez, L. E. Eguiarte. 2018. The lost world of Cuatro Cienegas Basin, a relictual bacterial niche in a desert oasis. eLIFE 2081:e38278. DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.38278.
  7. Patricia Velez, Margarita Ojeda, Laura Espinosa-Asuar, Tila M. Pérez, Luis E. Eguiarte, Valeria Souza. 2018. Experimental and molecular approximation to microbial niche: Trophic interactions among oribatid mites and microfungi in a freshwater oligotrophic system. PeerJ, 6:e5200. DOI 10.7717/peerj.5200
  8. Taboada B. , P. Isa, A.L. Gutiérrez-Escolano, R.M. del Ángel, J.E. Ludert, N. Vázquez, M.A. Tapia-Palacios, P. Chávez, E. Garrido, A.C. Espinosa, L.E. Eguiarte, S. López, V. Souza, and C.F. Arias. 2018. The Geographic Structure of Viruses in the Cuatro Ciénegas Basin, a Unique Oasis in Northern Mexico, Reveals a Highly Diverse Population on a Small Geographic Scale  Applied and Environmental Microbiology. doi: 10.1128/AEM.00465-18.
  9. Valeria Souza, Luis E. Eguiarte, James J. Elser, Michael Travisano and Gabriela Olmedo-Alvarez. (2018) A Microbial Saga: How to Study an Unexpected Hot Spot of Microbial Biodiversity from Scratch? A Short Introduction to Bacterial Studies in Cuatro Ciénegas. En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. E. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Págs. 1-20. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8, https://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_1
  10. Valeria Souza and Luis E. Eguiarte (2018) In the Beginning, There Was Fire: Cuatro  Ciénegas Basin (CCB) and the Long History  of Life on Earth. En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Págs. 21-34. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8, https://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_2
  11. P. Isa, B. Taboada, A. L. Gutiérrez, P. Chávez, R. M. del Ángel, J. E. Ludert,  A. C. Espinosa, L. E. Eguiarte, E. Garrido, S. López, V. Souza, and C. F. Arias (2018) Hyperdiverse Viral Communities in an Oligotrophic Oasis (Cuatro Ciénegas):  Marine Affinities and Microgeographic Differentiation. En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Págs. 43-56. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8,  https ://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_4
  12. Zulema Gomez-Lunar, Mirna Vázquez-Rosas-Landa, Gabriel Yaxal Ponce-  Soto, Alejandra Moreno-Letelier, Gabriela Olmedo-Alvarez, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza (2018) How Divergent Is the Cuatro Ciénegas Oasis? Genomic Studies of Microbial Populations  and Niche Differentiation. En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Págs. 57-72. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8, https ://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_5
  13. Patricia Vélez, Laura Espinosa-Asuar, Michael Travisano, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza (2018) The Niche at the Edge of Life or the Microbial Ecology (Including Microfungi) of Cuatro Ciénegas: Mutualisms with Locals, Antagonisms Against Foreigners . En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Págs. 73-82. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8,  https://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_6
  14. Nguyen E. López-Lozano, Silvia Pajares, Ana E. Escalante, Luis E. Eguiarte, Valeria Souza, and Gabriela Olmedo-Álvarez (2018) Microcosms and Mesocosms: A Way to Test the Resilience of Microbial Communities in Cuatro Ciénegas. En V. Souza, G. Olmedo-Alvarez, L. Eguiarte (eds.), Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology, Vol. 1. Cuatro Ciénegas Basin: an endangered hyperdiverse oasis. Springer International Publishing AG, Cham, Switzerland, Págs. 83-102. 134 pages. ISBN 978-3-319-93422-8, https://doi.org/10.1007/978-3-319-93423-5_7
  15. Yunuen Tapia-Torres, Patricia Vélez, Felipe García-Oliva, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza (2018) The Effect of Nutrient Availability on the Ecological Role of Filamentous Microfungi: Lessons from Elemental Stoichiometry,  in Felipe García-Oliva, James Elser,  Valeria Souza, Editors. Ecosystem Ecology and Geochemistry of Cuatro Cienegas. How to Survive in an Extremely Oligotrophic Site. Springer International Publishing AG, Cham, Switzerland. ISBN 978-3-319-95854-5. Págs. 43-54. 167 páginas. https://doi.org/10.1007/978-3-319-95855-2_6.
  16. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza. 2018. The Sulfur Cycle as the Gear of the “Clock of Life”: The Point of Convergence Between Geological and Genomic Data in the Cuatro Cienegas Basin. In Felipe García-Oliva, James Elser,  Valeria Souza, Editors. Ecosystem Ecology and Geochemistry of Cuatro Cienegas. How to Survive in an Extremely Oligotrophic Site. Springer International Publishing AG, Cham, Switzerland. ISBN 978-3-319-95854-5. Págs. 67-84. 167 páginas. https://doi.org/10.1007/978-3-319-95855-2_7
  17. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza (2018) Toward a Comprehensive Understanding of Environmental Perturbations in Microbial Mats from the Cuatro Cienegas Basin by Network Inference. In Felipe García-Oliva, James Elser,  Valeria Souza, Editors. Ecosystem Ecology and Geochemistry of Cuatro Cienegas. How to Survive in an Extremely Oligotrophic Site. Springer International Publishing AG, Cham, Switzerland. ISBN 978-3-319-95854-5. Págs. 85-98. 167 páginas.
  18. Jorge Valdivia-Anistro,  Luis E. Eguiarte, Valeria Souza (2018) Ecological Adaptability of Bacillus to Extreme Oligotrophy in the Cuatro Cienegas Basin. In Felipe García-Oliva, James Elser,  Valeria Souza, Editors. Ecosystem Ecology and Geochemistry of Cuatro Cienegas. How to Survive in an Extremely Oligotrophic Site. Springer International Publishing AG, Cham, Switzerland. ISBN 978-3-319-95854-5. Págs. 109-122. 167 páginas. https://doi.org/10.1007/978-3-319-95855-2_9.
  19. Valeria Souza, Gabriela Olmedo Álvarez y Luis E. Eguiarte (2018)  Genómica ambiental y metagenómica para describir la diversidad microbiana en Cuatro Ciénegas. En La biodiversidad en Coahuila. Estudio de Estado, Vol. II. Conabio/Gobierno del Estado de Coahuila de Zaragoza, México. ISBN 978-607-8570-00-3. Págs. 473-477. 541 páginas.
  20. Valeria Souza, Gabriela Olmedo Álvarez y Luis E. Eguiarte (2018) Diversidad genética microbiana en Cuatro Ciénegas. En La biodiversidad en Coahuila. Estudio de Estado, Vol. II. Conabio/Gobierno del Estado de Coahuila de Zaragoza, México. ISBN 978-607-8570-00-3. Págs. 467-472. 541 páginas
  21. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco, Augusto Cesar Poot-Hernandez, Bruno Contreras-Moreira, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza. 2017. MEBS, a software platform to evaluate large (meta)genomic collections according to their metabolic machinery: unraveling the sulfur cycle. GigaScience 6 (11) 1 November 2017: 1–17, https://doi.org/10.1093/gigascience/gix096.  
  22. Vazquez-Rosas-Landa, Mirna; Ponce-Soto, Gabriel; Eguiarte, Luis; Souza, Valeria. 2017. Comparative genomics of free-living Gamma-Proteobacteria. Pathogenesis-related genes or interaction-related genes? Pathogens and Disease 75: ftx059, 1-12.  DOI: https://doi.org/10.1093/femspd/ftx059.
  23. Zarraz M.-P. Lee, Amisha T. Poret-Peterson, Janet L. Siefert, Drishti Kaulf, Ahmed Moustafa, Andrew E. Allen, Chris L. Dupont, Luis E. Eguiarte, Valeria Souza, and James J. Elser. 2017. Nutrient stoichiometry shapes microbial community structure in shallow evaporictic pond. Frontiers in Microbiology. 8:949, 1-15. doi: 10.3389/fmicb.2017.00949,
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Estudiantes de doctorado activos en el laboratorio de Evolución Molecular y Experimental, marzo 2020.

Proyecto Cucurbita, las calabazas

Guillermo Sánchez de la Vega. Análisis de la diversidad genética de Cucurbita argyrosperma K. Koch (Cucurbitaceae) en México. Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Inició 2013. Candidatura abril 2015. Para recibirse en el 2020.

Ya tiene el siguiente artículo publicado:

Guillermo Sanchez de la Vega, Gabriela Castellanos-Morales, Niza Gámez, Helena S. Hernández-Rosales, Alejandra Vázquez-Lobo, Erika Aguirre-Planter, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2018. Genetic resources in the “calabaza pipiana” pumpkin (Cucurbita argyrosperma) in Mexico: Genetic diversity, genetic differentiation and distribution models. Frontiers in Plant Science. Volume 9 | Article 400.https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00400

Helena Socorro Hernández Rosales. Genética de poblaciones y filogeografía de Cucurbita moschata Duchesne ex Lam. Duchesne ex Poir. (Cucurbitaceae) en México. Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inició 2014. Candidatura aprobada abril 2016.

Ya tiene el siguiente artículo publicado:

Helena S. Hernández-Rosales, Gabriela Castellanos-Morales, Guillermo Sánchez de la Vega, Erika Aguirre-Planter, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte. 2020.  Phylogeographic and population genetic analyses of Cucurbita moschata reveal a domestication in Mesoamerica and divergence of two mitochondrial linages linked to an elevational gradient.  American Journal of Botany.107(3): 1–16.doi:10.1002/ajb2.1424.

Josué Barrera Redondo. Genómica comparada de la domesticación en Cucurbita argyrosperma. Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inició agosto 2015. Candidatura aprobada 2017.

Ya tiene el siguiente artículo publicado:

Josué Barrera-Redondo, Enrique Ibarra-Laclette, Alejandra Vázquez-Lobo, Yocelyn T. Gutierrez-Guerrero, Guillermo Sánchez de la Vega, Daniel Piñero, Salvador Montes-Hernández, Rafael Lira-Saade, Luis E. Eguiarte.  2019. The genome of Cucurbita argyrosperma (silver-seed gourd) reveals faster rates of protein-coding gene and long noncoding RNA turnover and neofunctionalization within Cucurbita. Molecular Plant, https://doi.org/10.1016/j.molp.2018.12.023.

Proyecto genómica de Leptonycteris y colibríes:

Jocelyn Teresa Gutiérrez Guerrero. Genómica evolutiva de murciélagos, con énfasis en la familia Phyllostomidae. Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inició 2015. Candidatura aprobada 2017. Premio Bernardo Villa 2019 de la North American Symposium on Bat Research, NASBR, al mejor proyecto de investigación en murciélagos por estudiantes en México. 

https://www.nasbr.org/villa/

Ana Paula Durán Suárez del Real. Genómica evolutiva de la nectarivoría en la familia Trochilidae (colibríes). Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inició 2018.

Otros proyectos: agaves, teosinte, helechos arborescentes, especies exóticas:

Ofelia Abigail Jiménez Barrón. Filogenia y diversificación del género Agave (Asparagaceae: Agavoideae). Doctorado programa Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Inició 2017. Candidatura aprobada en 2018.

Gabriel Merino Díaz. Patrones altitudinales de variación genética y morfológica en helechos arborescentes (Cyatheaceae). Doctorado programa Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Inició 2015. Candidatura aprobada 2016. Candidatura aprobada 2017.

Alejandra Gutiérrez Estrada. Estudios evolutivos de la mitocondria del teosintle (Zea mays ssp. parviglumis y Zea mays ssp. mexicana): genética de poblaciones, filogeografía y evolución molecular. Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inció 2012. Candidatura aprobada 2014.

 

Anaís Julieta Salomé Díaz. La fenología como indicadora de los efectos ecológicos de las especies exóticas sobre las nativas. Cotutoria con el Dr. Jordan K. Golubov F. Doctorado programa Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Inició 2019.

Alumnos posdoctorales

1) Fabián Vargas 1995. Proyecto Biología Evolutiva de la familia Agavaceae.

2) María del Carmen Mandujano 1995-1996. Proyecto Biología Evolutiva de la familia Agavaceae.

3) Sara V. Good, 2001-2002. Proyecto Filogenia y reloj molecular de la familia Agavaceae

4) Amanda Castillo 2007-2008. Proyecto Evolución y filogenia de Angiospermas, Sep-Conacyt.

5) César Abarca 2008-2009. Proyecto Evolución y filogenia de Angiospermas, Sep- Conacyt.

6) Norberto Martínez Méndez. 2009-2010. Proyecto “El nicho ecológico y su relación con la variación genética”, Conacyt.

7) Alejandra Vázquez Lobo Yurén. 2013: Genómica de poblaciones del teosinte. Proyecto Conacyt. Del 2014-2015. Diversidad genética de las especies de Cucurbita en México Proyecto CONABIO.

8) Alejandra Moreno Letelier. 2014-2015. Genómica de poblaciones del teosinte. Proyecto Conacyt.

9) Jaime Gasca Pineda. 2015-2016. Genómica de poblaciones del teosinte. Proyecto Conacyt.

11) Gabriela Castellanos Morales. 2015-2017. Diversidad genética de las especies de Cucurbita en México Proyecto CONABIO, co-asesor con el Dr. Rafael Lira.

12) Eria Alaide Rebollar Caudillo. 2017-2018. Proyecto Conacyt Investigación en Fronteras de la Ciencia, Genómica de la Diversidad de Vertebrados Mexicanos 1: Leptonycteris y la evolución de la nectarivoría en murciélagos y aves.

13) Margaux-Allison Fustier. 2017. Genómica de poblaciones del teosinte. Proyecto Conacyt.

14) Ileana Nuri Flores Abreu. 2018-2019.  Proyecto Conacyt Investigación en Fronteras de la Ciencia, Genómica de la Diversidad de Vertebrados Mexicanos 1: Leptonycteris y la evolución de la nectarivoría en murciélagos y aves. Abril 2018 a octubre 2019.

15) Jonás Andrés Aguirre Liguori. Genómica de poblaciones del teosinte. Proyecto Conacyt. 2018 a 2019.

16) Enrique Scheinvar Gottdiener. Genómica y diversidad en Cucurbita en México. Proyecto CONABIO, co-asesor con el Dr. Rafael Lira. 2018 a 2019.

17) Xitlali Aguirre Dugua. Evolución molecular y diversidad en Cucurbita en México. Proyecto CONABIO, co-asesor con el Dr. Rafael Lira. 2018 a 2019.

18) Jaime Gasca Pineda. Genómica y diversidad en Cucurbita en México. Proyecto CONABIO, co-asesor con el Dr. Rafael Lira. 2019 a 2020.

Estudiantes de doctorado ya graduados:

1) Silva, Arturo. 2001. Ecología reproductiva y genética de poblaciones de Agave lechuguilla (Torr.) en un gradiente latitudinal. Tesis de doctorado, Instituto de Ecología. Recibido el 30 de noviembre del 2001.

2) Golubov, Jordan. 2002. Dimorfismo en la producción de néctar: un acercamiento al proceso adaptativo de los caracteres florales. Tesis de doctorado, Facultad de Ciencias. Recibido el 5 de marzo del 2002.

3) Salvador Montes. 2002. Flujo génico en calabaza (Cucurbita spp.) dentro del sistema milpa en la parte central de México. Tesis de doctorado, Facultad de Ciencias. Recibido el 30 de agosto del 2002.

4) Aguirre Planter, Erika. 2005. Historia evolutiva de Abies guatemalensis, A. religiosa y A,. hickeli, especies con distribuciones y tamaños poblaciones contrastantes: estructura genética, flujo génico y conservación. Tesis de doctorado, Instituto de Ecología. Examen el 16 de marzo del 2005.

5) Valencia Avalos, Susana. 2005. Análisis filogenético de la serie Lanceolatae Trel. del género Quercus, Fagaceae. Tesis de doctorado, Posgrado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias. Examen el 11 de abril del 2005. (codirección con el Dr. Alfonso Delgado).

6) Rocha Munive, Martha Graciela. 2006. Ecología evolutiva comparada en cinco especies de Agave. Tesis de doctorado. Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM, D.F., México. Examen 8 de diciembre del 2006.

7) Jiménez Sierra, Cecilia Leonor 2008. Demografía y biología de Echinocactus platyacanthus Link et Otto, en el Valle de Tehuacán, Puebla. Tesis de doctorado, Facultad de Ciencias. Examen 15 de febrero 2008.

8) Sandra Luz Gómez Acevedo. 2010. Estudio comparativo de las tasas de diversificación de los subgéneros neotropicales de Acacia (Leguminosae: Mimosoideae) en México. Tesis de doctorado. Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Examen 10 de diciembre del 2010. Primer lugar área genética, concurso de tesis de posgrado, 2013, Sociedad Botánica de México, 24 de octubre, 2013.

9) Santiago Alejandro Ramírez Barahona. Genética de poblaciones y filogeografía de helechos arborescentes (Cyatheaceae). Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Inició agosto 2009, candidatura aprobada el 15 de abril del 2011. Examen 23 de octubre del 2014, recibido con Mención Honorífica.

10) Jaime Gasca Pineda. Genética de la conservación del bisonte de la pradera (Bison bison bison) y del borrego cimarrón (Ovis canadensis) en México. Tesis de doctorado. Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Examen 17 de Marzo 2015.  

11) Gabriela Castellanos Morales. Filogeografía y genética de la conservación de dos especies de perros de las praderas de cola negra (Cynomys ludovicianus y Cynomys mexicanus) con distribución en México. Posgrado de Ciencias Biológicas, UNAM. Recibida 21 de septiembre de 2015. 

12) Jonás Andrés Aguirre Liguori. Genómica de poblaciones del maíz silvestre, el teocintle (Zea mays ssp. parviglumis y Zea mays ssp. mexicana). Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM.  Recibido 4 de diciembre del 2017, mención honorífica.

13) Marco Antonio Rodríguez Rodríguez. Genética de la conservación de artiodáctilos mexicanos. Posgrado en Ciencias Biomédicas. Inició enero 2009, candidatura aprobada el 28 de octubre del 2010. Recibido 31 de enero 2018.

14) Enrique Scheinvar Gottdiener. Filogeografía de Agave lechuguilla y patrones de distribución de Agave en México. Posgrado en Ciencias Biomédicas. Inicio junio 2008, candidatura aprobada el 20 de abril del 2010. Segundo lugar concurso de tesis de doctorado, Instituto de Ecología, UNAM, 2016. Recibido 8 de marzo del 2018.

15) Ricardo Colín Nuñez. Ecología evolutiva de dos especies invasoras de humedales en la república mexicana: Arundo donax y Phragmites australis (Poaceae).Posgrado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Recibido 2 de agosto, 2019.

Estudiantes de maestría ya graduados:

1) Trejo Laura 2006. Genética de poblaciones de Agave striata Zucc. Maestría en Ciencias Biológicas (Biología Ambiental), Posgrado en Ciencias Biológicas. UNAM, D.F., México. Examen el 18 de septiembre del 2006, Mención honorífica.

2) Ileana Nuri Flores Abreu. 2007. Filogenia y coevolución entre las Agavaceae y sus polinizadores. Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM.  Examen 1 de octubre del 2007.

3) Scheinvar, Gottdiener, Enrique. 2008. Genética de poblaciones silvestres y cultivadas de dos especies mezcaleras: Agave cupreata y Agave potatorum. Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM. Examen el 4 de junio del 2008.

4) Arzate García, Karla María 2009: Distribución de cinco especies de Agave y su relación con algunos parámetros ambientales en Metztitlán, Hidalgo. Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM. Recibida el 28 de mayo del 2009.

5) Roberto Emiliano Trejo Salazar. 2013. Tiempos de divergencia de la familia Phyllostomidae (Chiroptera): Origen de la nectarivoría. Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM. Recibido 31 de mayo del 2013. Ganadora del Premio Bernardo Villa 2014.

6) Gabriel Merino Díaz. 2014. Genética de poblaciones de dos subespecies del maíz silvestre (Zea mays ssp mexicana y Zea mays ssp. parviglumis). Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM. Examen 27 de octubre del 2014.

Alumnos de licenciatura recibidos:

1) Pérez, J. Aspectos de Historia de natural y perspectivas de manejo de los pericos Amazona ochrocephala y A. virideginalis en el estado de Tamaulipas, Mex. Biólogo, Facultad de Ciencias, recibido en 1986.

2) Neira, L. Enfoque experimental para el estudio de los patrones de asignación en el género Phaseolus. Bióloga, Facultad de Ciencias, recibida en 1987 (dirigida junto con D. Piñero).

3) Rebón, M.F. Observaciones de frugivoría sobre un árbol neotropical y aspectos avifaunísticos en un bosque de niebla en Chiapas, México. Bióloga, Facultad de Ciencias, recibida en 1987.

4) Vargas, F. Determinación del tamaño efectivo en una población de Echeveria gibbiflora D.C. en el Pedregal de San Angel, C.U., México. Biólogo, Facultad de Ciencias, recibido en 1988.

5) Parra, V. Ecología de la polinización en una población de Echeveria gibbiflora DC en el Pedregal de San Angel, C.V., México. Biólogo, Facultad de Ciencias, recibido en 1988.

6) Hernández B. Hábitos alimenticios y descripción de las com­unidades de aves de bosque de encino y bosque de Juniperus en Ixcateopan, Guerrero. Bióloga, Facultad de Ciencias, recibida en 1990 (codirigida junto con A. Navarro).

7) Larson, J. Estudio demográfico de Echeveria gibbiflora DC. (Crasulaceae) en el Pedregal de San Angel. Biólogo, Facultad de Ciencias, recibido en 1992 (dirigida junto con C. Cordero).

8) Navarro Quezada, Aura Rocío. Estructura genética y procesos de especiación de Agave cerulata (Trel.) y Agave subsimplex (Trel.) en el desierto Sonorense a partir de RAPD's. Bióloga, Facultad de Ciencias, recibida el 3 de junio de 1999.

9) Cadaval Narezo, Alejandro. Estudio evolutivo de los azúcares del nectar de Agave lechuguilla en el desierto de Chihuahua. Bólogo, Facultad de Ciencias, recibido el 3 de junio de 1999 (dirigida junto con A. Silva).

10) González Chauvet, Rodrigo. Analsis de variación genética de Agave deserti en el desierto sonorense por medio de marcadores moleculares (RAPDs), Bólogo, Facultad de Ciencias recibido el 29 de febrero del 2000.

11) Tambuti, Marcia, Patrones de diversidad del género Agave en México: una síntesis para su conservación. Tesis de Licienciatura, Facultad de Ciencias, recibida el 12 de abril del 2002 (dirigida junto con Arturo Silva).

12) Aguirre Dugua, Xitlali. Genética de poblaciones de Agave potatorum y Agave cupreata: Aportaciones para el manejo y conservación de dos especies mezcaleras. Tesis de licienciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Recibida el 19 de marzo del 2004. Mención Honorífica.

13) González González, Andrea. Biología reproductiva y genética de poblaciones de Agave garciae-mendozae. Tesis de licenciatura. Codirección con Martha Rocha. Facultad de Ciencias, UNAM. Recibida el 23 de abril, 2004. Mención Honorífica.

14) Colín Nuñez, Ricardo. 2006. Análisis de la diversidad genética y estructura poblacional de Agave xylonacantha (Agavaceae) utilizando “Inter Simple Sequence Repeats” (ISSR) como marcador molecular. Tesis de Licenciatura, Biólogo Facultad de Ciencias, UNAM. Codirección con Martha Rocha. Recibido el 23 de junio del 2006.

15) Trejo, Roberto. 2007. Ecología de la polinización en el género Agave en la Barranca de Metztitlán. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Examen 18 de septiembre del 2007. Codirección con Martha Rocha.

16) Huerta Chagoya, Alicia. 2007. Estructura genética de una población mestiza mexicana, con base en cinco marcadores nucleares y cinco mitocondriales. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Examen 11 Octubre 2007. Codirección con Wendy Argelia García Suastegui.

17) Rodríguez Rodríguez Marco Antonio. 2008. Caracterización y análisis de la diversidad genética de borrego cimarrón (Ovis canadensis) en Sonora y BCS, México, con fines de manejo sustentable. FES Iztacala, UNAM.  Examen el 6 de junio del 2008. Codirección con Jaime Gasca.

18) Ochoa Hein, Alexander. 2008. Diversidad y estructura genética espacio-temporal de la ardilla terrestre de Perote (Spermophilus perotensis): Implicaciones para su conservación. Alumno del Taller de licenciatura. Recibido el 7 de noviembre del 2008.  Codirección con Jaime Gasca.  

19) Rives Guendulain Roxana Celeste. 2009.  Diversidad clonal y estructura genética espacial en escala fina de Agave striata Zucc. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM.. Codirección con Enrique Scheinvar. Recibida 25 de agosto del 2009.

20) Ramírez Barahona, Santiago Alejandro. 2009. Variación genética y filogeografía de helechos arborescentes (Cyatheaceae) del Bosque Mesófilo de Montaña de las Sierra Madre Oriental. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Recibido el 4 de Junio 2009.

21) Barceinas Cruz, Alicia. 2011. Genética de poblaciones de Furcraea parmentieri: estimaciones de variación y estructura genética usando ISSR’s. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Alumna del Taller de licenciatura. Codirección con Erika Aguirre Planter. Examen 2 de diciembre 2011.

22) Aguirre Liguori, Jonás. 2012. Genética de poblaciones y filogeografía de Fouquieria shrevei (Familia Fouquieriaceae), especie gipsófila endémica de Coahuila.Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Alumno del Taller de licenciatura. Codirección con Enrique Scheinvar. Examen el 27 de febrero del 2012. Premio a la mejor tesis de licenciatura, Sociedad Científica Mexicana de Ecología, 22 de marzo 2013.

23) Torres Orozco Jiménez, Daniel. 2012.  Filogeografía y genética de la conservación del venado Bura (Odocoileus hemionus) en México. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Alumno del Taller de licenciatura. Codirección con Marco Antonio Rodríguez. Examen 23 de agosto del 2012.

24) Martínez Aisworth, Natalia Elena. Genética de poblaciones de Agave stricta Salm.Dyck, especie endémica al Valle de Tehuacán-Cuicatlán, México. Tesis de licenciatura. Facultad de Ciencias, UNAM. Alumna del Taller de Licenciatura. Codirección con Enrique Scheinvar Gottdiener.  Examen 12 de junio del 2013. Mención honorifica en el concurso de mejor Tesis de Licenciatura "Carlos Chávez Solís", Facultad de Ciencias, UNAM.

25) Alberto Villasante Barahona. 2013. Diversidad y estructura genética del teocintle anual Zea mays ssp. parviglumis Iltis & Doebley y Zea mays ssp. mexicana (Schrader) Iltis, en un gradiente geográfico y ambiental. Tesis de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. Codirección con Jaime Gasca. Examen el 5 de diciembre del 2013.

26) Gutiérrez Guerrero Yocelyn Teresa, 2014. Efecto del cautiverio sobre la diversidad genética de una población de perrito de la pradera mexicano (Cynomys mexicanus). Codirección con Gabriela Castellanos. Tesis de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. Examen 9 de septiembre del 2014.

27) Josué Barrera Redondo. 2014. Factores morfológicos y ambientales asociados a los cambios en la tasa de sustitución en helechos. Tesis de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. Codirección con Santiago Ramírez Barahona. Examen 22 de septiembre del 2014.

28) Parra Leyva José Gilberto. 2015. Variación genética y diferenciación en poblaciones de Agave kerchovei Lem. usando marcadores de cloroplasto. Tesis de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. Codirección con Erika Aguirre Planter. Examen 17 de junio del 2015.

29) Leslie Mariel Paredes Torres. 2016.  Filogenia Molecular del Género Cucurbita L. (Cucurbitaceae) Usando Secuencias de Cloroplasto. Tesis de Licenciatura.  Facultad de Estudios Superiores Iztacala, UNAM. Codirección con Gabriela Castellanos Morales. Examen 2 de septiembre 2016.

30) Karen Yazmín Ruiz Mondragón. Filogeografía y diversidad genética en Cucurbita pepo L. 1753 en México. Tesis de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. Codirección con Gabriela Castellanos Morales. Examen 24 de mayo, 2017.