Semblanza
La doctora María Elena Álvarez-Buylla Roces ejerce un importante liderazgo científico internacional en las áreas de biología de sistemas con enfoques teórico-computacionales en genética molecular, epigenética y ecología evolutiva del desarrollo, que combina con una actividad constante para coadyuvar a la conservación de la diversidad biológica y a la promoción de una ciencia comprometida con la equidad, la justicia y el beneficio social. En ciencia básica, ha hecho contribuciones importantes en áreas teóricas y experimentales fundamentales y aplicadas a la biomedicina; así como en biología de poblaciones vegetales, con base en su trabajo de campo en las selvas mexicanas y en bosques templados; y en torno a la bioseguridad del maíz.
Al término de sus estudios de licenciatura y de maestría, en la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), fue distinguida con la medalla “Gabino Barreda” en ambos niveles. En 1982 se tituló como licenciada en biología con una tesis sobre el uso de los recursos vegetales en la zona de los Tuxtlas y, en 1985, obtuvo el grado de maestría en ciencias con el estudio de la dinámica y genética de poblaciones de un árbol tropical, en el contexto del mosaico de regeneración de la selva en la misma región. En 1986 realizó su doctorado en la Universidad de California, en Berkeley, bajo la tutoría del Profesor en matemáticas aplicadas, Montgomery Slatkin. Su tesis presentada en 1992, Dynamics of Tropical Rain Forests: Models for Populations and Genes, combina enfoques demográficos y genéticos con un componente teórico importante para el estudio de la biología de poblaciones. Realizó una estancia posdoctoral en genética molecular del desarrollo en la misma Universidad de California, pero ahora en el campus La Jolla, en donde inició proyectos de la genética molecular del desarrollo y el planteamiento de modelos de redes regulatorias, publicando a su regreso a México el primer modelo del mundo de la dinámica de una red regulatoria compleja, anclada en datos experimentales, para explicar la diferenciación celular.
A partir de entonces, su grupo de investigación ha mantenido un liderazgo importante a nivel internacional en el uso de formalismos de sistemas complejos, para entender cómo la información genética se mapea en los rasgos visibles de los seres vivos (fenotipo), y entender la ecología evolutiva del desarrollo, así como la importancia de este en la evolución de los organismos vivos. Ha sido invitada como profesor visitante a algunos de los institutos de investigación más prestigiosos del mundo en esta área (Universidades de Uppsala en Suecia, y de Barcelona en España, University College en el Reino Unido, Instituto Santa Fe y Miller en Estados Unidos). Es cofundadora del Centro de Ciencias de la Complejidad de la UNAM, en el cual ha estado a cargo de la Coordinación Académica hasta el 30 de noviembre de 2018.
En 1992, se incorporó al Instituto de Ecología de la UNAM en donde actualmente es investigadora titular “C” de tiempo completo, con permiso sin goce de sueldo. Desde 2001 tiene el nivel III en el Sistema Nacional de Investigadores y cuenta con el nivel máximo (D), dentro del Programa de Primas al Desempeño del Personal Académico de Tiempo Completo de la UNAM.
Su notable trabajo de campo, teórico y experimental ha cristalizado en modelos matemáticos demográfico-genéticos dinámicos, acerca del sistema de regeneración de selvas y los efectos de cosecha y probabilidad de extinción en especies útiles. Estos modelos han resultado instrumentales para la conservación y manejo de las selvas en el mundo, pero sobre todo en Latinoamérica. Ha coadyuvado de manera importante al conocimiento y conservación de la biodiversidad de las selvas mexicanas. Por ejemplo, coordinó en colaboración con el Instituto de Biología, un estudio que llevó al descubrimiento de más de 20 especies nuevas para la ciencia. La doctora Álvarez-Buylla también estudió la dispersión de transgenes en las razas y variedades locales del maíz en México y ha contribuido a la bioseguridad de este cereal, fundamental en nuestro país. También realizó investigaciones en la especie mexicana única, Lacandonia schismatica, que ha sido vértice de todos sus intereses científicos y útil para la preservación de las selvas tropicales; y también ha estudiado la filogenia y genética de poblaciones de pinos, con implicaciones en la conservación de bosques templados. Desde que volvió de su posdoctorado se ha enfocado en el estudio de la ecología evolutiva del desarrollo, contribuyendo en la frontera de la biología de sistemas, en el entendimiento de los mecanismos sistémicos de la diferenciación celular y la morfogénesis, así como el balance entre proliferación y diferenciación celular usando distintos órganos y estados del ciclo de vida de Arabidopsis thaliana (desarrollo floral, subdiferenciación celular de la epidermis, nicho de células troncales, transición a la floración) como sistemas de estudio, también ha estudiado el papel de las vías hormonales y las respuestas plásticas de los organismos en distintos ambientes. Su trabajo teórico está enfocado en descubrir los mecanismos genéricos del desarrollo y su evolución que subyacen tras patrones fenotípicos conservados, así como también las bases de las especificidades y del papel constructivo del ambiente en retroalimentación con las redes complejas. Ha contribuido al conocimiento funcional y evolutivo de genes MADS-box, reguladores importantes del desarrollo vegetal y animal. Recientemente, está aplicando sus enfoques al entendimiento de la emergencia de enfermedades complejas como por ejemplo el cáncer y enfermedades inflamatorias.
Su producción científica primaria cuenta con más de 816 productos entre los que destacan: 176 artículos internacionales indizados, 7 libros, 29 capítulos de libros internacionales, múltiples obras de difusión y divulgación de la ciencia, así como un programa de computación para estudios de poblaciones naturales y manejadas, utilizado por cientos de usuarios en todo el mundo. El impacto de sus aportaciones a nivel nacional e internacional se refleja en más de 11,957 citas a su trabajo y los reconocimientos recibidos por varios de sus artículos. Además, de realizar una extensa labor de difusión del conocimiento en cientos de entrevistas y artículos en diferentes medios. Ha sido invitada a impartir conferencias magistrales en más de 139 congresos y simposios nacionales e internacionales. Ha colaborado en labores editoriales, comisiones y comités científicos como organizadora, y tenido una extraordinaria labor de apoyo al desarrollo de la ciencia en México y en el mundo, a través de su proactiva participación en comisiones y comités de evaluación de proyectos, y como editora asociada de revistas prestigiosas en su campo, y en la organización de diversos simposios, congresos y reuniones científicas.
La doctora Álvarez-Buylla también ha trabajado de manera activa en la formación de nuevos investigadores dirigiendo a: 19 estudiantes de licenciatura, 9 de maestría y 24 de doctorado; e impartido 67 cursos de licenciatura y de posgrado. Asimismo, en su laboratorio se han desempeñado 24 investigadores posdoctorantes, tres investigadores asociados y seis técnicos académicos. Muchos de sus estudiantes y colaboradores han obtenido algunas de las becas posdoctorales más prestigiadas del mundo o son ya investigadores en universidades importantes.
Su experiencia en la administración pública y administración incluye su participación en el Consejo Consultivo Científico de la CIBIOGEM, Comisiones de las Cámaras de Senadores y Diputados de la República Mexicana para la modificación de diferentes leyes. Es miembro fundador, coordinadora general desde 2008 y fue presidenta durante dos periodos (2011-2012 y 2015-2016) de la Unión de Científicos Comprometidos con la Sociedad, organización empeñada en la responsabilidad ética y el compromiso socio-ambiental de la ciencia en temas nodales para México. Es fundadora y actual Coordinadora de Investigación del Centro de Ciencias de la Complejidad C3, UNAM y fue jefa del Departamento de Ecología Funcional del Instituto de Ecología, UNAM (2008-2012). Ahora es Directora General del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (2018-2024), desginada por el Presidente de los Estados Unidos Mexicanos, el licenciado Andrés Manuel López Obrador.
Su trabajo ha sido reconocido con 50 distinciones y becas, entre las que destacan: "Young Investigator Award" de la Sociedad de “American Naturalists”, Estados Unidos, 1994; Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos 1997; Premio Nacional de Investigación de la Academia Mexicana de Ciencias (Ciencias Naturales) 1999; Premio Ciudad Capital: “Heberto Castillo Martínez” del Instituto de Ciencia y Tecnología del Gobierno del Distrito Federal, Premio Universidad Nacional 2010 (Investigación en Ciencias Naturales), Medalla Faustino Miranda del Instituto de Ecología, UNAM; Beca Miller del Instituto Miller para la Investigación Básica en Ciencia, Universidad de California, Berkeley, USA, Premio Nacional a la Investigación Científico-Tecnológica UASLP 2016. Fue galardonada con el Premio Nacional de Ciencias Físico-Matemáticas y Naturales 2017.
Líneas de Investigación
Estudiamos los mecanismos de genética molecular y la evolución de mecanismos de desarrollo en plantas. Combinamos estudios evolutivos de genes clave en los mecanismos de desarrollo o análisis comparativos de los mecanismos de desarrollo en especies con morfologías contrastantes, con estudios funcionales de genes involucrados en los mecanismos de desarrollo y enfoques teóricos encaminados al uso de herramientas computacionales o formales para la integración de los datos.
Palabras Clave: 3ra Evolución, genética molecular, biología del desarrollo, Evo-Devo, plantas, morfogénesis de plantas, evolución molecular, epigenética.
Formación Académica
- Posdoctorado en la Universidad de California, La Jolla, San Diego, USA. (9/97-12/99).
- Doctorado en Botánica en la Universidad de California, Berkeley (U.S.A.) (9/86-3/92). Tesis: Dynamics of Tropical Rain Forests: Models for Populations and Genes. (3/1992).
- Maestría en Ciencias (ecología vegetal) en el Instituto de Biología, UNAM (9/82-8/85). Tesis: Demografía y Dinámica Poblacional de Cecropia obtusifolia Bertol en La Selva de Los Tuxtlas, México. (2/1986).
- Licenciatura en Biología en la Facultad de Ciencias, UNAM (8/79-8/82). Tesis: Estudio Etnobotánico en Balzapote, Veracruz: Los Solares. (9/1983).
Estancias Académicas
- Estancia en University of California, Berkeley, en el Laboratorio de la Dra. Chelsea Specht y el Instituto Miller for Basic Research (15 agosto, 2012 - 14 agosto, 2013).
- Estancia del 18 de diciembre al 14 de enero del 2006, en el Santa Fe Institute, Estados Unidos. (18/05-14/06).
- Honorary Position, estancia del 1º de septiembre de 2004 al 23 de agosto de 2005, en University College London, Reino Unido, Laboratorio del Dr. Beau Lotto. (09/04-08/05).
- Estancia del 15 julio al 11 de agosto de 2004, en el Santa Fe Institute, Estados Unidos. (07/04-08/04).
- Estancia del 1º de julio al 30 de agosto de 2003, Universidad de Uppsala, Suecia, laboratorio del Dr. Peter Engström. (06/03-07/03).
Experiencia profesonal
- Consultor Científico para análisis estadístico, Programa de Ciencia y Tecnología de "El Colegio de México", México. (agosto 1985 - julio 1986).
- Investigador Titular "A" de Tiempo Completo, Centro de Ecología, UNAM, México. (abril 1992- abril 1995).
- Investigador Titular “B” de Tiempo Completo, Instituto de Ecología, UNAM, México. (abril 1995 – abril 2000).
- Investigador Titular “C” de Tiempo Completo, Instituto de Ecología, UNAM, México. (junio 2000 – 30 noviembre 2018).
- Titular del Departamento de Ecología Funcional del Instituto de Ecología, UNAM, México. (15 junio, 08 – 15 agosto, 2012).
- Miembro fundador y miembro del Consejo Directivo del Centro de Ciencias de la Complejidad C3, UNAM. (2007 – 2018).
Cargos de Alto Nivel Decisivo (Administrativo y Técnico-Científico)
- Titular: Ecología Funcional (Instituto de Ecología, UNAM), México (15 junio, 2008 – 15 agosto, 2012).
- Directivo del Centro de Ciencias de la Complejidad, UNAM, México (2008 – 2014).
- Directora General (Presidenta) de la Unión de Científicos Comprometidos con la Sociedad (2008 - 2009; 2010 - 2011; 2015 - 2016).
- Directora General del Laboratorio de Genética, Epigenética, Desarrollo y Evolución de Plantas del Instituto de Ecología, UNAM (1995- 2018).
- Coordinadora de Investigación Científica del Centro de Ciencias de la Complejidad, UNAM (27 octubre 2014 – 30 noviembre 2018).
- Directora General del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT) (1 diciembre 2018- 30 noviembre 2024).
Otros Puestos Importantes
- Miembro del Consejo Consultivo de Bioseguridad de Cibiogem (2002 – 2004).
- Miembro de la Comision Dictaminadora del Instituto de Biología, UNAM (8 diciembre 2006 – diciembre 2010).
- Miembro de la Comisión Dictaminadora del Centro de investigación sobre Ecosistemas, UNAM (7 marzo 2007 – 7 junio 2010).
Premios y Distinciones
53. Miembro del Comité Asesor, Plataforma Regional para el Avance en la Producción de Vacunas y otras Tecnologías Sanitarias para la COVID-19 en las Américas (mayo 2022 - ).
52. Renovación PRIDE “D”, UNAM (2021-2026).
51. Artículo destacado en la Colección Top 100 en Biología Celular y Molecular. Esta colección destaca nuestros artículos de biología celular y molecular más descargados publicados en 2020:
- García-Gómez, Mónica L.; Ornelas-Ayala, Diego; Garay-Arroyo, Adriana; García-Ponce, Berenice; de la Paz Sánchez, María & Álvarez-Buylla, Elena R.
(2020). A system-level mechanistic explanation for asymmetric stem cell fates: Arabidopsis thaliana root niche as a study system. Nature, Scientific Reports 10, 3525 (February, 2020). doi: 10.1038/s41598-020-60251-8 (Este artículo tiene 8 citas).
50. Miembro del Consejo Consultivo de Ciencias, Presidencia de la República (marzo de 2018 - ).
49. Premio Nacional de Ciencias 2017 Gobierno de la República Mexicana.
48. Renovación PRIDE “D”, UNAM (2016-2021).
47. Premio Nacional a la Investigación Científico-Tecnológica UASLP 2016 (octubre de 2016).
46. Juez del Primer Encuentro Nacional de Niños y Jóvenes Investigadores del Programa Adopte un talento (PAUTA), Ciudad de México (23 de julio de 2016).
45. Miembro del H. Jurado calificador del Premio Heberto Castillo de la Ciudad de México 2016, Por una Ciudad ConCiencia Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del D.F.
44. Miembro de la Junta Directiva de la Universidad Autónoma Metropolitana 2016- (12 de abril de 2016 - ).
43. Diploma “Al Mérito Universitario” por su labor durante 25 años en la Universidad Nacional Autónoma de México (mayo 2016).
42. Miembro del H. Jurado calificador del Premio Heberto Castillo de la Ciudad de México 2015, Por una Ciudad ConCiencia Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del D.F.
41. Miembro del Comité editorial de la Revista Molecular Plant, como Editor Asociado (enero 2015 a la fecha).
40. Miembro del Jurado calificador del Premio México de Ciencia y Tecnología 2014.
39. Presidenta del jurado calificador del Premio Heberto Castillo de la Ciudad de México, 2014.
38. Reconocimiento público y felicitación de la Universidad Nacional Autónoma de México a los académicos de carrera más citados en el 2013 en las Revistas científicas. Gaceta UNAM (8 diciembre 2014). Actualmente la Dra. María Elena Álvarez-Buylla Roces ha sido citada 11,957 veces.
37. Ponente en el Sexto Festival Internacional de Mentes Brillantes (Ciudad de las Ideas) 2013. Puebla. México (7-8 noviembre, 2013).
36. Miembro del jurado calificador del Premio Heberto Castillo de la Ciudad de México, 2013.
35. Invitación para escribir “An Overview article for BioScience” revista mensual del American Institute of Biological Sciences (agosto, 2013).
34. Reconocimiento: “Donald Kaplan Memorial Address”, Congreso de Botánica 2013, de la American Botanical Society, Nueva Orleans, USA, (julio, 2013).
33. Reconocimiento “Miller Fellow” como investigador visitante, Instituto Miller para la Investigación Básica en Ciencia, Universidad de California, Berkeley, USA. (septiembre - diciembre, 2012). Nota en el Boletín de la UNAM.
32. Finalista al Premio de Investigación Científica en Conservación Biológica del Programa Volkswagen, “Por Amor al Planeta”, 6ª. Edición, 2011.
31. Miembro del Sistema Nacional de Investigadores nivel III. (enero, 2001 - diciembre, 2020).
30. Reconocimiento Mentes Quo+Discovery Channel “Embajadora del Conocimiento –Premio: Mente Ciencia–. México (octubre, 2011).
29. Medalla Faustino Miranda, Instituto de Ecología, UNAM. (2011)
28. Diploma de reconocimiento por 20 años de servicios académicos en la Universidad Nacional Autónoma de México (julio, 2010).
27. Premio Universidad Nacional 2010. Área: Investigación en Ciencias Naturales.
26. Reconocimiento del Programa Doctorado en Ciencias Biomédicas, como uno de los tutores que más alumnos ha graduado (agosto, 2010).
25. Miembro regular de la Academia Mexicana de Ciencias (octubre, 2010 – a la fecha).
24. ARABIDOPSIS BOOK: Invitación a escribir y publicación del artículo "Flower Development" (2010) en este volumen, que es la referencia obligada para los investigadores que usan este sistema modelo. (Este artículo tiene 246 citas).
23. Miembro de Pugwash Conferences on Science and World Affairs. Esta organización y su coordinador, J Rotblat, recibieron el Premio Nobel de la Paz en 1995.
22. Reconocimiento de Thomson Reuters: a la publicación más citada enla última década: Mendoza, L.,& Álvarez-Buylla, E.R. (1998). Dynamics of the genetic regulatory network for Arabidopsis thaliana flower morphogenesis. Journal of theoretical Biology 193(2): 307-319, (agosto, 2009). (Este artículo tiene 301 citas).
21. Reconocimiento: Museo Papalote del Niño. CUATRO Científicos Mexicanos sobresalientes: al lado de otros tres investigadores (entre quienes está el Premio Nobel Mario Molina), aparece como investigadora mexicana ejemplar.
20. BMC-Systems Biology: Artículo reseñado en primera plana como uno de los tres más interesantes y citados del número en que apareció: Díaz, J. and Álvarez-Buylla, E.R. (2009). “Information flow during gene activation by signaling molecules: Ethylene transduction in Arabidopsis cells as a study system”. BMC-Systems Biology 3:48. (Este artículo tiene 18 citas).
19. “Faculty of 1000” Artículos sobresalientes:
- Espinosa-Soto, C.; Padilla-Longoria, P. & Álvarez-Buylla, E.R. (2004). A gene regulatory network model for cell-fate determination during Arabidopsis thaliana flower development that is robust and recovers experimental gene expression profiles. The Plant Cell, 16(11): 2923-2939. Reseñado como uno de los más consultados. (Este artículo tiene 492 citas).
- Martínez-Castilla, L.P. & Álvarez-Buylla, E.R. (2003). Adaptive evolution in the Arabidopsis MADS-box gene family inferred from its complete resolved phylogeny. Proceedings of The National Academy of Sciences of the United States of America, 100(23):13407-13412. (Este artículo tiene 168 citas).
- Ambrose, B.A.; Espinosa-Matías, S.; Vázquez-Santana, S.; Vergara-Silva, F.; Martínez, E.; Márquez-Guzmán, J. & Álvarez-Buylla, E.R. (2006). Comparative developmental series of the mexican triurids support a euanthial interpretation for the unusual reproductive axes of Lacandonia schismatica (Triuridaceae). American Journal of Botany, 93(1): 15-35. (Este artículo tiene 48 citas).
- Dyer, G.A.; Serratos-Hernández, J.A.; Perales, H.R.; Gepts, P.; Piñeyro-Nelson, A.; Chávez, A.; Salinas-Arreortua, N.; Yúnez-Naude, A.; Taylor,J.E.; and Álvarez-Buylla, E.R. (2009). Dispersal of Transgenes through Maize Seed Systems in Mexico. PloS ONE, 4(5): e5734. doi:10.1371/journal.pone.0005734. (Este artículo tiene 101 citas).
18. Premio Ciudad Capital: “Heberto Castillo Martínez” Instituto de Ciencia y Tecnología del Gobierno del Distrito Federal, en Salud y Medio Ambiente Premio "Blanca Elena Jiménez Cisneros" (2008).
17. Premio: The Grady L. Webster Award. Sociedad Americana de Botánica (Botanical Society of America) al mejor artículo de Botánica Estructural de 2005 y 2006 por la publicación: Barbara A. Ambrose, … and Elena R. Álvarez-Buylla for their paper entitled, “Comparative developmental series of the Mexican triurids support a euanthial interpretation for the unusual reproductive axes of Lacandonia schismatica (Triuridaceae)”. (2007). American Journal of Botany. 93(1): 15-35. (Este artículo tiene 48 citas).
16. PRIDE nivel “D” (2006 – a la fecha).
15. Diploma de Reconocimiento por 15 años de servicios Académicos en la UNAM. UNAM (julio, 2005).
14. Miembro fundador y activo del “Faculty of 1000” desde su creación. (1999 – a la fecha).
13. Reconocimiento “Sor Juana Inés de la Cruz” a profesoras e investigadoras por destacarse en labores de docencia, investigación y difusión de la cultura, otorgado por la UNAM. (agosto, 2005).
12. “International Fellow”, Santa Fe Institute, USA. (2004-2006).
11. Premio de investigación de la Academia Mexicana de Ciencias (Ciencias Naturales). (octubre, 1999).
10. Distinción “Universidad Nacional para Jóvenes Académicos 1997”, Universidad Nacional Autónoma de México. (noviembre, 1997).
9. Reconocimiento de la Fundación Pew, “Latin American Fellow”, University of California San Diego, La Jolla Ca., USA. (septiembre, 1996 - septiembre, 1998).
8. Miembro del Sistema Nacional de Investigadores nivel II. (1 julio 1995 – 30 junio 2001).
7. Reconocimiento "Freund Foundation Visiting Ecologist Program for Outstanding Scholars". Reconocimiento e invitación para impartir una serie de seminarios y discutir los proyectos de investigadores y estudiantes de la Universidad de Missouri, St. Louis. Patrocinado por el International Center for Tropical Ecology (octubre, 1994).
6. Premio a jóvenes investigadores en Estados Unidos, "Young Investigator Award" de la Sociedad de “American Naturalist”, Estados Unidos. (julio, 1994).
5. Miembro del Sistema Nacional de Investigadores nivel I (1 julio, 1992 – 30 junio, 1995).
4. Distinción "Dora Garibaldi" al Mérito Académico de University of California, Berkeley, Estados Unidos (septiembre, 1990 – agosto, 1991).
3. Medalla "Gabino Barreda" al mejor promedio en la Maestría en Ciencias de la Facultad de Ciencias, UNAM (enero, 1986).
2. Mención Honorífica a tesis de Licenciatura otorgada por la Sociedad Botánica de México (1983).
1. Medalla "Gabino Barreda" al mejor promedio en la Licenciatura de Biología de la Facultad de Ciencias, UNAM. (25 noviembre, 1983).
Proyectos de Investigación Actuales
INECC 2017
"Monitoreo de la presencia de secuencias transgénicas en cultivos de maíz en sitios prioritarios de México"
PAPIIT 2017
"De las redes genéticas a la morfogénesis en los nichos de células troncales en la raíz de Arabidopsis thaliana"
Problemas Nacionales 2015
"Desarrollo, optimización e implementación de nuevas tecnologías moleculares y cartográficas de biomonitoreo de transgenes y herbicidas en maíz en México: hacia una estrategia y panorama integrales de bioseguridad"
Ciencia Básica 2014
"Interacción de redes de genes MADS-Box (tipo MEF) con vías de respuesta a especies reactivas de oxígeno en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana: un modelo para tumorigénesis"
Publicaciones
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Artículos en Revistas Internacionales Arbitradas e Indizadas
Artículos en Revistas Nacionales Arbitradas e Indizadas
Capítulos de Libros Arbitrados e Internacionales
Artículos Publicados en Memorias en Extenso
Artículos de Divulgación de la Ciencia
Artículos Aceptados para Publicarse o en PrePrint
Artículos en Revistas Internacionales Arbitradas e Indizadas
2022
176. López-Ruiz, B.A.; Quezada-Rodríguez, E.H.; Piñeyro-Nelson, A.; Tovar, H.; García-Ponce, B.; Sánchez, M.d.l.P.; Álvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. (2022). Combined Approach of GWAS and Phylogenetic Analyses to Identify New Candidate Genes That Participate in Arabidopsis thaliana Primary Root Development Using Cellular Measurements and Primary Root Length. Plants, Volume 11, Issue 22, 3162, November 2022. doi: 10.3390/plants11223162 EISSN 2223-7747.
175. Chávez-Hernández E.C., Quiroz S., García-Ponce B. and Álvarez-Buylla E.R. (2022). The flowering transition pathways converge into a complex gene regulatory network that underlies the phase changes of the shoot apical meristem in Arabidopsis thaliana. Frontiers in Plant Science. August 2022, 13:852047. doi: 10.3389/fpls.2022.852047 Electronic ISSN: 1664-462X.
174. Bensussen A., Valcarcel A., Álvarez-Buylla E.R. and Díaz J. (2022). ORF8 and Health Complications of COVID-19 in Down Syndrome Patients. Frontiers in Genetics. February 2022, 13:830426. doi: 10.3389/fgene.2022.830426 ISSN: 1664-8021.
173. Hernández-Herrera, Paul; Ugartechea-Chirino, Yamel; Torres-Martínez, Héctor H.; Arzola, Alejandro V.; Chairez-Veloz, José Eduardo; García-Ponce, Berenice; Sánchez, María de la Paz; Garay-Arroyo, Adriana; Álvarez-Buylla, Elena R.; Dubrovsky, Joseph G. and Corkidi, Gabriel. (2022). Live Plant Cell Tracking: Fiji plugin to analyze cell proliferation dynamics and understand morphogenesis. Plant Physiology, Volume 188, Issue 2, February 2022, Pages 846–860. doi: 10.1093/plphys/kiab530 Online ISSN 1532-2548.
172. Alejo-Vinogradova, M Teresa; Ornelas-Ayala, Diego; Vega-León, Rosario; Garay-Arroyo, Adriana; García-Ponce, Berenice; Álvarez-Buylla, Elena R. and Sanchez, María de la Paz. (2022). Unraveling the role of epigenetic regulation in asymmetric cell division during plant development. Journal of Experimental Botany, Volume 73, Issue 1, 5 January 2022, Pages 38–49. doi: 10.1093/jxb/erab421. Online ISSN 1460-2431.
2021
171. Bensussen, Antonio; Álvarez-Buylla, Elena R. and Díaz José. (2021). SARS-CoV-2 Nsp5 Protein Causes Acute Lung Inflammation, A Dynamical Mathematical Model. Frontiers in Systems Biology. December 2021, 1:764155. doi: 10.3389/fsysb.2021.764155 Electronic ISSN: 2674-0702.
170. Valcarcel A., Bensussen A., Álvarez-Buylla E.R. and Díaz J. (2021). Structural Analysis of SARS-CoV-2 ORF8 Protein: Pathogenic and Therapeutic Implications. Frontiers in Genetics. September 2021, 12:693227. doi: 10.3389/fgene.2021.693227 ISSN: 1664-8021. (Este artículo se ha citado 1 vez).
169. Caldu-Primo, Jose Luis; Verduzco-Martínez, Jorge Armando; Alvarez-Buylla, Elena R and Davila-Velderrain, Jose. (2021). In vivo and in vitro human gene essentiality estimations capture contrasting functional constraints. NAR Genomics and Bioinformatics, Volume 3, Issue 3, September 2021. doi: 10.1093/nargab/lqab063 Online ISSN 2631-9268.
168. Quiroz, S.; Yustis, J.C.; Chávez-Hernández, E.C.; Martínez, T.; Sanchez, M.d.l.P.; Garay-Arroyo, A.; Álvarez-Buylla, E.R.; García-Ponce, B. (2021). Beyond the Genetic Pathways, Flowering Regulation Complexity in Arabidopsis thaliana. International Journal of Molecular Sciences. May 2021, 22(11):5716. doi: 10.3390/ijms22115716 EISSN: 1422-0067.
167. Zluhan-Martínez, E.; López Ruíz, B. A.; García-Gómez, M. L.; García-Ponce, B.; de la Paz Sánchez, M.; Álvarez-Buylla, E.R and Garay-Arroyo, A. (2021). Integrative Roles of Phytohormones on Cell Proliferation, Elongation and Differentiation in the Arabidopsis thaliana Primary Root. Frontiers in Plant Science. April 2021, 12:659155. doi: 10.3389/fpls.2021.659155 Electronic ISSN: 1664-462X. (Este artículo se ha citado 1 vez).
166. García-Gómez M.L, Garay-Arroyo A., García-Ponce B., Sánchez M.P. and Álvarez-Buylla E.R. (2021). Hormonal Regulation of Stem Cell Proliferation at the Arabidopsis thaliana Root Stem Cell Niche. Frontiers in Plant Science. March 2021, 12:628491. doi: 10.3389/fpls.2021.628491 Electronic ISSN: 1664-462X. (Este artículo se ha citado 2 veces).
165. Ornelas-Ayala D., Garay-Arroyo A., García-Ponce B., R. Álvarez-Buylla E. and Sanchez M.P. (2021). The Epigenetic Faces of ULTRAPETALA1. Frontiers in Plant Science. February 2021, 12:637244. doi: 10.3389/fpls.2021.637244 Electronic ISSN: 1664-462X. (Este artículo se ha citado 1 vez).
164. Díaz J. and Álvarez-Buylla, E. R. (2021). Spatio-Temporal Dynamics of the Patterning of Arabidopsis Flower Meristem. Frontiers in Plant Science. February 2021, 12:585139. doi: 10.3389/fpls.2021.585139. Electronic ISSN: 1664-462X.
2020
163. López-Ruiz, B.A.; Zluhan-Martínez, E.; Sánchez, M.P.; Álvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. (2020). Interplay between Hormones and Several Abiotic Stress Conditions on Arabidopsis thaliana Primary Root Development. Cells, December 2020, 9, 2576. doi: 10.3390/cells9122576 EISSN 2073-4409. (Este artículo se ha citado 5 veces).
162. García-Gómez, Mónica L.; Castillo-Jiménez, Aaron; Martínez-García, Juan Carlos; Álvarez-Buylla, Elena R. (2020). Multi-level gene regulatory network models to understand complex mechanisms underlying plant development. Current Opinion in Plant Biology, Volume 57, October 2020, Pages 171-179. doi: 10.1016/j.pbi.2020.09.004 ISSN 1369-5266. (Este artículo se ha citado 3 veces).
161. Enciso J., Mendoza L., Álvarez-Buylla E.R., Pelayo R. (2020). Dynamical modeling predicts an inflammation-inducible CXCR7+ B cell precursor with potential implications in lymphoid blockage pathologies. PeerJ-Life and Environment, September 2020, 8:e9902. doi: 10.7717/peerj.9902 ISSN: 2167-8359. (Este artículo se ha citado 3 veces).
160. Zluhan-Martínez, E.; Pérez-Koldenkova, V.; Ponce-Castañeda, M.V.; Sánchez, M.P.; García-Ponce, B.; Miguel-Hernández, S.; Álvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. (2020). Beyond What Your Retina Can See: Similarities of Retinoblastoma Function between Plants and Animals, from Developmental Processes to Epigenetic Regulation. International Journal of Molecular Sciences, Volume 21, Issue 14, 4925, July 2020. doi: 10.3390/ijms21144925 EISSN: 1422-0067. (Este artículo se ha citado 5 veces).
159. Cárdenas-González, M. & Álvarez-Buylla, E.R. (2020). The COVID-19 pandemic and paradigm change in global scientific research | La pandemia de COVID-19 y el cambio de paradigma en la investigación científica mundial. MEDICC Review. April 2020; Volume 22, No. (2): 14–18. ISSN 1527-3172. Disponible en: http://mediccreview.org/the-covid-19-pandemic-and-paradigm-change-in-global-scientific-research (Este artículo se ha citado 3 veces).
158. Weinstein Nathan, Mendoza Luis, Álvarez-Buylla Elena R. (2020). A Computational Model of the Endothelial to Mesenchymal Transition. Frontiers in Genetics, Volume 11, Article 40, March 2020, pp. 26. doi:10.3389/fgene.2020.00040 ISSN: 1664-8021. (Este artículo se ha citado 8 veces).
157. García-Gómez, M. L., Ornelas-Ayala, D., Garay-Arroyo, A., García-Ponce, B., Sánchez, M. P., & Álvarez-Buylla, E. R. (2020). A system-level mechanistic explanation for asymmetric stem cell fates: Arabidopsis thaliana root niche as a study system. Nature, Scientific Reports, February 2020, 10(1), 3525. doi:10.1038/s41598-020-60251-8 (Este artículo se ha citado 9 veces).
156. Ornelas-Ayala, D.; Vega-León, R.; Petrone-Mendoza, E.; Garay-Arroyo, A.; García-Ponce, B.; Álvarez-Buylla, E.R. and Sanchez, M.d.l.P. (2020). ULTRAPETALA1 maintains Arabidopsis root stem cell niche independently of ARABIDOPSIS TRITHORAX1. New Phytologist, Volume 225, Issue 3, February 2020, 1261-1272 pp. doi:10.1111/nph.16213 Online ISSN: 1469-8137. (Este artículo se ha citado 3 veces).
155. Carolina Ureta, Edgar J. González, Alejandro Espinosa, Alejandro Trueba, Alma Piñeyro-Nelson, Elena R. Álvarez-Buylla. (2020). Maize yield in Mexico under climate change. Agricultural Systems, Volume 177, January 2020, 102697, ISSN: 0308-521X, doi:10.1016/j.agsy.2019.102697 (Este artículo se ha citado 25 veces).
2019
154. Cajero-Sanchez, W.; Aceves-Garcia, P.; Fernández-Marcos, M.; Gutiérrez, C.; Rosas, U.; García-Ponce, B.; Álvarez-Buylla, E.R.; Sánchez, M.P. and Garay-Arroyo, A. (2019). Natural Root Cellular Variation in Responses to Osmotic Stress in Arabidopsis thaliana Accessions. Genes, Volume 10, Issue 12:983, November 2019, 1-23 pp. doi:10.3390/genes10120983 (Este artículo se ha citado 5 veces).
153. Álvarez-Buylla, E.R., García-Ponce, B., Sánchez, M.d.l.P., Espinosa-Soto, C., García-Gómez, M.L., Piñeyro-Nelson, A. and Garay-Arroyo, A. (2019). MADS-box genes underground becoming mainstream: plant root developmental mechanisms. New Phytologist, Volume 223, Issue 3, August 2019, 1143-1158 pp. doi:10.1111/nph.15793 (Este artículo se ha citado 15 veces).
152. Castelán-Muñoz, C.; Herrera, J.; Cajero-Sánchez, W.; Arrizubieta, M.; Trejo, C.; Garcia-Ponce, B.; Sánchez, Mp.P.; Álvarez-Buylla, E.R. and Garay-Arroyo, A. (2019). MADS-box Genes are Key Components of Genetic Regulatory Networks Involved in Abiotic Stress and Plastic Developmental Responses in Plants. Frontiers in Plant Science, Volume 10, Article 853, July 2019, 1-18 pp. doi: 10.3389/fpls.2019.00853 (Este artículo se ha citado 30 veces).
2018
151. Caldu-Primo, Jose L., Alvarez-Buylla, Elena R. & Davila-Velderrain, Jose. (2018). Structural robustness of mammalian transcription factor networks reveals plasticity across development. Scientific Reports 8:13922 doi:10.1038/s41598-018-32020-1. ISSN: 2045-2322 (Este artículo se ha citado 3 veces).
150. Martinez-Sanchez, Mariana E.; Huerta, Leonor; Alvarez-Buylla, Elena R. and Villarreal Luján, Carlos. (2018). Role of Cytokine Combinations on CD4+ T Cell Differentiation, Partial Polarization, and Plasticity: Continuous Network Modeling Approach. Frontiers in Physiology. Vol. 9. pp. 877. doi: 10.3389/fphys.2018.00877. ISSN: 1664-042X (Este artículo se ha citado 22 veces).
149. Cortes-Poza, Yuriria, Padilla-Longoria, Pablo and Alvarez-Buylla, Elena. (2018). Spatial dynamics of floral organ formation. Journal of Theoretical Biology, Vol. 454. pp. 30- 40. doi:10.1016/j.jtbi.2018.05.032. ISSN: 0022-5193. (Este artículo se ha citado 1 vez).
148. Corina Diana Ceapa, Melissa Vázquez-Hernández, Stefany Daniela Rodríguez-Luna, Angélica Patricia Cruz Vázquez, Verónica Jiménez Suárez, Romina Rodríguez-Sanoja, Alvarez-Buylla, E.R. and Sergio Sánchez. (2018). Genome mining of Streptomyces scabrisporus NF3 reveals symbiotic features including genes related to plant interactions. PLoS ONE 13(2): e0192618. doi:10.1371/journal.pone.0192618 (Este artículo se ha citado 11 veces).
2017
147. Wendy Cajero Sánchez, Berenice García-Ponce, María de la Paz Sánchez, Elena R. Álvarez-Buylla & Adriana Garay-Arroyo. (2017). Identifying the transition to the maturation zone in three ecotypes of Arabidopsis thaliana roots. Communicative & Integrative Biology, 11:1, doi: 10.1080/19420889.2017.1395993 Online ISSN: 1942-0889. (Este artículo se ha citado 11 veces).
146. Piñeyro-Nelson A., Sosa-Peredo D., González-Ortega E. and Álvarez-Buylla E.R. (2017). There Is More to Corn than Popcorn and Corn on the Cob! Frontiers Young Minds 5:64. doi:10.3389/frym.2017.00064 Electronic ISSN: 2296-6846.
145. E. González-Ortega, A. Piñeyro-Nelson, E. Gómez-Hernández, E. Monterrubio-Vázquez, M. Arleo, J. Dávila-Velderrain, C. Martínez-Debat & E.R. Álvarez-Buylla. (2017). Pervasive presence of transgenes and glyphosate in maize-derived food in Mexico. Agroecology and Sustainable Food Systems, 41:9-10, 1146-1161, September 2017. doi: 10.1080/21683565.2017.1372841 Online ISSN: 2168-3573 (Este artículo se ha citado 16 veces).
144. Martinez-Sanchez, M.E., Hiriart, M. & Alvarez-Buylla, E.R. (2017). The CD4+ T cell regulatory network mediates inflammatory responses during acute hyperinsulinemia: a simulation study. BMC Systems Biology 11, 64 (2017). doi: 10.1186/s12918-017-0436-y ISSN: 1752-0509 (Este artículo se ha citado 4 veces).
143. García-Gómez M.L., Azpeitia E., and Álvarez-Buylla E.R. (2017). A dynamic genetic-hormonal regulatory network model explains multiple cellular behaviors of the root apical meristem of Arabidopsis thaliana. PLoS Computational Biology 13(4): e1005488. April 2017. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005488 ISSN 1553-7358 (Este artículo se ha citado 19 veces).
142. Azpeitia, E., Muñoz,S., Gonzalez-Tokman, D., Martínez-Sánchez, M.E., Weinstein, N., Naldi, A., Alvarez-Buylla, E.R., Rosenblueth, D.A. and Mendoza, L. (2017). The combination of the functionalities of feedback circuits is determinant for the attractors' number and size in pathway-like Boolean networks. Nature, Scientific Reports, 7, 42023; doi: 10.1038/srep42023 ISSN 2045-2322 (Este artículo se ha citado 13 veces).
141. Romero-Arias, R., Hernández-Hernández, V., Benítez, K.M., Barrio, R. and Álvarez-Buylla, E.R. (2017). Model of polar auxin transport coupled to mechanical forces retrieves robust morphogenesis along the Arabidopsis root. Physical Review Letters, 95(3), 032410 doi: 10.1103/PhysRevE.95.032410 ISSN 2470-0053 (Este artículo se ha citado 11 veces).
140. Méndez-López, L.F., Davila-Velderrain, J., Domínguez-Hüttinger, E., Enríquez-Olguín, C., Martínez-García, J.C. & Alvarez-Buylla, E.R. (2017). Gene regulatory network underlying the immortalization of epithelial cells. BMC Systems Biology 11, 24 (February 2017). doi: 10.1186/s12918-017-0393-5 ISSN: 1752-0509 (Este artículo se ha citado 16 veces).
2016
139. Libertad Pantoja-Hernández, Elena Álvarez-Buylla, Carlos F. Aguilar-Ibáñez, Adriana Garay-Arroyo, Alberto Soria-López and Juan Carlos Martínez-García. (2016). Retroactivity effects dependency on the transcription factors binding mechanisms. Journal of Theoretical Biology, Volume 410, December 2016, Pages 77-106. doi: 10.1016/j.jtbi.2016.08.012 ISSN 0022-5193.
138. Mario A. Pacheco-Escobedo, Victor B. Ivanov, Iván Ransom-Rodríguez, Germán Arriaga-Mejía, Hibels Ávila, Ilya A. Baklanov, Arturo Pimentel, Gabriel Corkidi, Peter Doerner, Joseph G. Dubrovsky, Elena R. Álvarez-Buylla, Adriana Garay-Arroyo. (2016). Longitudinal zonation pattern in Arabidopsis root tip defined by a multiple structural change algorithm. Annals of Botany, Volume 118, Issue 4, October 2016, Pages 763–776. doi: 10.1093/aob/mcw101 Online ISSN: 1095-8290 (Este artículo se ha citado 16 veces).
137. Karla V. García-Cruz, Berenice García-Ponce, Adriana Garay-Arroyo, María De La Paz Sanchez, Yamel Ugartechea-Chirino, Bénédicte Desvoyes, Mario A. Pacheco-Escobedo, Rosalinda Tapia-López, Ivan Ransom-Rodríguez, Crisanto Gutierrez and Elena R. Alvarez-Buylla. (2016). The MADS-box XAANTAL1 increases proliferation at the Arabidopsis root stem-cell niche and participates in transition to differentiation by regulating cell-cycle components. Annals of Botany, Volume 118, Issue 4, October 2016, Pages 787–796. doi: 10.1093/aob/mcw126 Online ISSN 1095-8290 (Este artículo se ha citado 10 veces).
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135. Aceves-García P, Álvarez-Buylla ER, Garay-Arroyo A, García-Ponce B, Muñoz R and Sánchez MP. (2016). Root Architecture Diversity and Meristem Dynamics in Different Populations of Arabidopsis thaliana. Frontiers Plant Science. 7:858, June 2016. doi: 10.3389/fpls.2016.00858 ISSN 1664-462X (Este artículo se ha citado 13 veces).
134. Elena R. Álvarez-Buylla, Jose Dávila-Velderrain, Juan Carlos Martínez-García. (2016). Systems Biology Approaches to Development beyond Bioinformatics: Nonlinear Mechanistic Models Using Plant Systems. BioScience, Volume 66, Issue 5, 01 May 2016, Pages 371–383. doi: 10.1093/biosci/biw027 Online ISSN 1525-3244 (Este artículo se ha citado 13 veces).
133. J. Davila-Velderrain, J. C. Martinez-Garcia and E. R. Alvarez-Buylla. (2016). Dynamic network modelling to understand flowering transition and floral patterning. Journal of Experimental Botany, Volume 67, Issue 9, April 2016, Pages 2565–2572. doi: 10.1093/jxb/erw123 Online ISSN 1460-2431 (Este artículo se ha citado 14 veces).
Artículos en Revistas Nacionales Arbitradas e Indizadas
2022
22. Patricia Delgado-Valerio, Angela Ramón-Amado, Alma Piñeyro-Nelson, Elena R. Álvarez-Buylla, N. Mariana Ayala-Angulo y Agustín Molina-Sánchez. (2022). Presencia de secuencias transgénicas en masa para tortillas de poblados urbanos y rurales de la Meseta Purépecha, Michoacán, México. Revista Fitotecnia Mexicana, Septiembre 2022, Vol. 45 (3): 283-292. doi: 10.35196/rfm.2022.3.283 ISSN 0187-7380.
2017
21. Elena R. Álvarez-Buylla, Adriana Garay-Arroyo, Berenice García-Ponce de León, María de la Paz Sánchez, Emmanuel González-Ortega, José Dávila-Velderrain, Juan Carlos Martínez-García y Alma Pineyro-Nelson. (2017). La Ecología Evolutiva del Desarrollo en México | Developmental Evolutionary Ecology in Mexico. Revista Mexicana de Biodiversidad 88 (2017) 14–26. doi: 10.1016/j.rmb.2017.10.009 ISSN: 2007-8706 (Este artículo se ha citado 6 veces).
2018
7. Cancer: a complex disease. Alvarez-Buylla, E.R., Balandran, J.C., Caldu-Primo, J.L., Davila-Velderrain, J., Enciso, J., Hernandez-Lemus, E., Lopez Castillo, L.S., Martinez-Garcia, J.C., Mejia-Dominguez, N.R., Paiva, L.R.., Pelayo, R. Resendis-Antonio, O. & Valadez-Blanco, O. (2018). Octavio Miramontes & Elena R. Álvarez-Buylla, Editors. Ed. CopIt-arXives, 116pp. ISBN 978-1-938128-15-8 ebook.
6. Modeling Methods for Medical Systems Biology. Regulatory Dynamics Underlying the Emergence of Disease Processes. Álvarez-Buylla, E.R., Martinez-Garcia, J.C., Dávila-Velderrain, J., Domínguez-Hüttinger, E., Martínez-Sánchez, M.E. (2018). Ed. Springer, 258pp. doi: 10.1007/978-3-319-89354-9 ISBN 978-3-319-89353-2 ISBN 978-3-319-89354-9 (eBook).
2017
5. Memoria histórica de Tapa-baa. La defensa de la tierra, los espacios sagrados y los principios de la vida comunal en San Juan Tabaá, Oaxaca, México. Melitón Bautista Cruz (2017). 2ª edición CopIt-arXives. Editores: Valiana Aguilar, Elena Álvarez-Buylla, Mariana Benítez, Gabriela Coronado, Gustavo Esteva, Octavio Miramontes y Eduardo Vizcaya. 191pp. ISBN: 978-1-938128-11-0 ebook.
Capítulos de Libros Arbitrados e Internacionales
2020
31. María Elena Álvarez-Buylla. (2020). Chapter 2, 2.3 Pillar 3: Economic Response and Recovery Programs in the book UN Research Roadmap for the COVID-19 Recovery: Leveraging the Power of Science for a More Equitable, Resilient and Sustainable Future. United Nations, NYC, USA, November 2020.
2019
30. María Elena Álvarez-Buylla. (2019). Towards a Policy on Coordination between the Humanities, Sciences and Technology (Conacyt) in the New Mexican Government. In the chapter “A regional Approach: The Latin American University: Science and Technology Seen from the Humanities-Emer(conver)ging Issues” in the book Higher Education in the World 7, Humanities and Higher Education: Synergies between Science, Technology and Humanities. GUNi: Global University Network for Innovation Press. First Edition: Barcelona, December 2019. 519-526 pp. ISBN: 987-84-09-14675-8
29. Álvarez-Buylla, Elena R.; Dávila-Valderraín, José; Martínez García, Juan Carlos; Verduzco-Martínez, Jorge A. (2019). Beyond (non)genetics: Rethinking Inheritance as a Complex Emergent Process. In: Muñoz Rubio, Julio. (coordinador) La biología evolutiva contemporánea: ¿una revolución más en la ciencia? Universidad Nacional Autónoma de México, ISBN 978-607-30-1052-8. 149-162pp.
2018
27. Davila-Velderrain J., Caldu-Primo J.L., Martinez-Garcia J.C. and Alvarez-Buylla E.R. (2018). Modeling the Epigenetic Landscape in Plant Development. In: von Stechow L., Santos Delgado A. (eds) Computational Cell Biology. Methods in Molecular Biology, vol 1819. Humana Press, New York, NY., 357-383pp. doi:10.1007/978-1-4939-8618-7_17, ISBN: 978-1-4939-8617-0 (Este capítulo se ha citado 2 veces).
2017
25. Davila-Velderrain, J., Martinez-Garcia, J.C. and Alvarez-Buylla, E.R. (2017). Boolean Dynamic Modeling Approaches to Study Plant Gene Regulatory Networks: Integration, Validation, and Prediction. In: Kaufmann K., Mueller-Roeber B. (eds) Plant Gene Regulatory Networks. Methods in Molecular Biology, Vol 1629, 297-315pp. Humana Press, New York, NY. doi: 10.1007/978-1-4939-7125-1_19 ISBN 978-1-4939-7124-4 (Este capítulo se ha citado 4 veces).
2013
14. Azpeitia, Eugenio; Weinstein, Nathan; Benítez, Mariana; Mendoza, Luis and Alvarez-Buylla Elena R. (2013). Finding missing interactions of the Arabidopsis thaliana root stem cell niche gene regulatory network. Root Systems Biology. Topic Editor: Wolfgang Schmidt. Frontiers in Plant Science, Plant Systems Biology. Volume 4, Article 110, 97-116pp., (April 2013). ISSN 1664-8714 ISBN 978-2-88919-275-5 doi: 10.3389/978-2-88919-275-5.
Artículos Publicados en Memorias en Extenso
26. García Ponce de León, Berenice; Quiroz Pérez, Stella; Yustis Rubio, Juan Carlos; Martínez Hidaglo, Tania; Garay-Arroyo, Adriana; Sánchez Jimenez, María de la Paz y Álvarez-Buylla, Roces Elena. (2020). La regulación genética de la floración. Memoria del 47º Taller de Actualización Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM. Mensaje Bioquímico 44 (2020) 20-30pp, Junio 2020. ISSN-0188-137X.
25. Jennifer Enciso, Elena Álvarez-Buylla, Rosana Pelayo. (2017). A multi-modular boolean network for the study of acute lymphoblastic leukemia. Experimental Hematology, Volume 53, Supplement, August 2017, Page S109, ISSN 0301-472X, doi: 10.1016/j.exphem.2017.06.268 (Este artículo se ha citado 1 vez).
Tesis Dirigidas
21. Investigación de propiedades estructurales y dinámicas subyacentes a la troncalidad: una perspectiva de sistemas complejos a la biología de células troncales embrionarias. Tesis que para optar por el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta José Luis Caldú Primo; tutora principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2022.
20. Espacios de articulación producción-consumo de alimentos agroecológicos en la Ciudad de México. Tesis que para optar por el grado de Doctora en Geografía, presenta Luz Vanessa Pérez Tapia; tutores principales de tesis Stéphane Robert André Couturier, Patricia Eugenia Olivera Martínez, María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2019.
19. Modelos sistémicos y dinámicos del tamaño de los nichos de células troncales: la raíz de Arabidopsis thaliana como modelo. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Mónica Lisette García Gómez; tutora principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2018.
18. Modelación de la diferenciación de células T cooperadoras. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Mariana Esther Martínez Sánchez; tutora principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2017.
17. El papel de los mecanismos regulatorios de la transcripción en la retroacción. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Libertad Pantoja Hernández; tutores principales de tesis Juan Carlos Martínez García, Elena Álvarez Buylla Roces, Adriana Garay Arroyo. UNAM-2017.
16. Papel del gen MADS-box, XAL1/AGL12 en la homeostasis celular del meristemo radicular de arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Karla Verónica García Cruz; tutora principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2016.
15. Modelo dinámico de la red de regulación del ciclo celular de arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Elizabeth Ortiz Gutiérrez; tutora principal de tesis Ma. Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2016.
14. La decisión del destino celular como una propiedad emergente en un paisaje epigenético: modelos dinámicos de circuitos y módulos genéticos. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta José Dávila Velderrain; tutor principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2015.
13. Análisis funcional de genes mads-box en el desarrollo de arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Rosalinda Tapia López; tutor principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2015.
12. Desarrollo de un modelo computacional para la simulación del proceso de formación de la vulva en caenorhabditis elegans. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Nathan Weinstein Zagorín; tutores principales de tesis Luis Antonio Mendoza Sierra, María Elena Álvarez Buylla Roces, Rosa Navarro González. UNAM-2015.
11. Modelo dinámico de la red genética del nicho de células madre de la raíz de arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Eugenio Martín Azpeitia Espinosa; tutor principal de tesis María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2014.
10. De los mecanismos moleculares a la morfogénesis, el desarrollo y la evolución: el caso de la flor homeótica de lacandonia schismatica. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biomédicas, presenta Alma Amparo Piñeyro Nelson; tutora principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2013.
9. Impacto, vulnerabilidad y adaptación de las razas mexicanas de maíz ante escenarios de cambio climático. Tesis que para obtener el grado de Doctorado en Ciencias Biológicas, presenta Carolina Ureta Sánchez; tutor principal de tesis Enrique Martínez Meyer, María Elena Álvarez Buylla Roces, Robert Bye Boettler. UNAM-2013.
8. Redes genéticas y diferenciación celular en tejidos epidérmicos de Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Mariana Benítez Keinrad; asesor Elena Álvarez-Buylla Roces. UNAM-2010.
7. Importancia biológica y evolutiva de la estructura y de la dinámica de redes genéticas pequeñas: modelos de simulación inspirados en redes reales. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Álvaro Chaos Cador; asesor María Elena Álvarez-Buylla Roces. UNAM-2010.
6. Redes de regulacion génica: herramientas para entender el desarrollo en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Carlos Arturo Espinosa Soto; asesor Roces Alvarez-Buylla. UNAM-2007.
5. Filogenia y evolución molecular de los genes de la familia MADS-box en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Leon Patricio Martinez Castilla; asesor María Elena Alvarez-Buylla Roces. UNAM-2004.
4. Evolución de los mecanismos del desarrollo ontogénico de los fenotipos florales homeoticos/heterotopicos en las triuridales mexicanas Lacandonia schismatica y Triuris brevistylis (Triuridales: Liliopsida). Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Francisco Roberto Vergara Silva; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2002.
3. Genes MADS-box en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana: patrones de expresión in situ y análisis filogenético. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Caroline Nicole Laura Burgeff D'Hondt; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2001.
2. Modelos de morfogénesis en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, presenta Luis Antonio Mendoza Sierra; asesores María Elena Álvarez Buylla Roces, Jaime Lagunes Otero, Julio Collado Vides. UNAM-2000.
1. Evolución y filogenia en pinos y sus hongos endofitos: aspectos sistemáticos de la coespeciación. Tesis que para obtener el grado de Doctor en Ecología, presenta Sol Ortiz Garcia; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1999.
9. Modelo espacio-temporal del transporte de auxina en el nicho de células troncales de la raíz de Arabidopsis Thaliana. Tesis que para obtener el grado de Maestría en Ciencias Bioquímicas, presenta Mónica Lisette García Gómez; tutor principal de tesis María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2014.
8. Participación de los genes mads en la red transcripcional que regula la homeostasis celular de la raíz de arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Maestría en Ciencias Biológicas, presenta Victor Rogelio Hernández Marroquín; tutor principal de tesis Adriana Garay Arroyo; María Elena Alvárez Buylla Roces, Alejandra Alicia Covarrubias Robles. UNAM-2014.
7. Caracterización funcional de AGL17 en el desarrollo radicular de Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias Biológicas, presenta Gabriel Sinué Fonseca Salazar; asesor Berenice García Ponce de León, Elena Álvarez-Buylla Roces, Joseph Dubrovsky. UNAM-2011.
6. La morfogénesis en diferenciación celular de flores: Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias (Física), presenta José Roberto Romero Arias; asesor Rafael Ángel Barrio Paredes, María Elena Álvarez-Buylla Roces, Carmen Varea Gilabert. UNAM-2011.
5. Función del gen MADS-box AGL 19 durante el desarrollo floral de Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias Biológicas, presenta Anidia Blanco Jarvio; asesor Elena Alvarez-Buylla Roces. UNAM-2006.
4. Papel funcional de dos genes MADS-box tipo SOC1 (AGL19 y AGL14), en las vias de regulacion de la transicion a la floracion. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias Biologicas, presenta Mitzi Villajuana Bonequi; asesor María Elena Alvarez-Buylla Roces. UNAM-2006.
3. Evolución molecular de genes MADS-Box tipo B y su papel en el origen y la evolución del desarrollo floral. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias Biológicas, presenta Tania Hernandez Hernandez; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2005.
2. Estructura demográfica y genética de una especie del género Pinus (Pinus rzedowkkii Madrigal et Caballero), endémica del estado de Michoacán, México. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ciencias (Biología Vegetal), presenta Patricia Delgado Valerio; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1997.
1. La región de los espaciadores internos transcritos (ITS) del DNA ribosomal del nucleo (NrDNA): detección de hibridación y variacion intraespecífica en pinos. Tesis que para obtener el grado de Maestro en Ecología Básica, presenta Jesus Adrian Quijada Mascareñas; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1996.
19. Acople de redes de regulación de la diferenciación y el ciclo celular: la raíz de Arabidopsis thaliana como modelo. Tesis que para obtener el título de Licenciado en Biología, presenta Jorge Arturo Arciniega González; asesora María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2020.
18. Secuencias transgénicas en alimentos elaborados con maíz: México, un caso de estudio. Tesis que para obtener el título de Licenciatura en Química de Alimentos, presenta Elsa Antonieta Gómez Hernández; asesores Emmanuel González Ortega, Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2017.
17. Análisis comparativo de los modelos de red booleana de la regulación del ciclo celular en eucariontes. Tesis que para obtener el título de Licenciatura en Biología, presenta Aarón Castillo Jiménez; asesora María Elena Álvarez Buylla Roces. UNAM-2015.
16. Revisitando el modelo de red de regulación genética que subyace la determinación de los órganos florales Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Yara Elena Sánchez Corrales; asesor María Elena Álvarez-Buylla Roces. UNAM-2009.
15. Conservación funcional parcial de los genes de la funcion B de Lacandonia schismatica en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Eduardo Flores Sandoval; asesor María Elena Alvarez-Buylla Roces, Adriana Garay Arroyo. UNAM-2007.
14. Restricciones analíticas de las técnicas de biomonitoreo de organismos genéticamente modificados de uso agrícola: estudio de caso de muestras de maíz procedentes de la Sierra Norte de Oaxaca. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Alma Amparo Piñeyro Nelson; asesor Maria Elena Alvarez-Buylla Roces. UNAM-2007.
13. Análisis de la función del gen mads-box agl21 usando líneas de sobre-expresión en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Anidia Blanco Jarvio; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2004.
12. Análisis preliminar de la función del gen MADS-box AGL 19 en el desarrollo de Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Mitzi Villajuana Bonequi; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2004.
11. Estudio de las posibles funciones de dos proteinas que interactuan in vitro con un factor de transcripción de la familia MADS: establecimiento de las lineas mutantes homocigas. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Esther Zuñiga Sanchez; asesor Maria Isabel Gamboa de Buen, María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2004.
10. Un modelo de red de regulación génica para la determinación de órganos florales en arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Carlos Arturo Espinosa Soto; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2003.
9. Caracterización molecular y análisis funcional preliminar de una mutante del desarrollo floral en Arabidopsis thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Tania Hernandez Hernandez; asesor Alicia Gamboa de Buen, María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2003.
8. Análisis funcional preliminar de AGL19, un gen MADS-box específico de la raíz de Arobidopsis thaliana (L) Heynh. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Amanda Ochoa Espinosa; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2002.
7. Análisis funcional preliminar de un gen Mads-box en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Enrique Ortiz Moreno; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2002.
6. Análisis funcional de ortologos de los genes MADS-BOX de función "B" de Lacandonia schismatica en líneas transgénicas de Arabidopsis Thaliana. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Jose Eduardo de la Torre Barcena; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-2000.
5. Filogenia de pinos mexicanos, con base en los espaciadores internos transcritos (ITS) del nrDNA y su aplicación a hipótesis biogeográficas y adaptativas. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Maria Guadalupe Mendez Cardenas; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces, Daniel Piñero Dalmau. UNAM-1998.
4. La inferencia filogenética como una aproximación a la historia natural del género de hongos endofitos Laphodermium Chev. (Ascomycota) en dos especies mexicanas de pinos. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Rodolfo Salas Lizana; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1998.
3. Filogenia de hongos endofitos del género Pinus L.: implementación de técnicas moleculares y resultados preliminares. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Yuren Alejandra Vazquez Lobo; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1996.
2. Métodos no paramétricos para obtener límites de confianza de tasas de crecimiento poblacional estimadas con modelos matriciales de Leslie. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Alvaro Chaos Cador; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1993.
1. Montaje de un sistema de loci polimórficas para una especie arborea neotropical Cecropia obtusifolia. Tesis que para obtener el título de Biólogo, presenta Adriana Garay Arroyo; asesor María Elena Alvarez Buylla Roces. UNAM-1991.
4. Modelo de la red de regulación genética de la transición a la floración. Elva Carolina Chávez Hernández. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM.
3. Caracterización de la red booleana obtenida a partir del acoplamiento del módulo que describe el ciclo celular y el módulo que describe la transición epitelio-mesénquima. Alexis Hernández Magaña. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Ingreso 2017-2.
2. El papel de las redes de retinoblastoma-related y XAANTAL1 como mediadores de porliferación y diferenciación celular en respuesta a ambientess oxido-reductivos en la raíz de Arabidopsis thaliana. Joel Herrera Martínez. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Ingreso 2015-1.
1. Acoplamiento de mecanismos físicos y genético- moleculares en la morfogénesis de la raíz de Arabidopsis thaliana. Aaron Castillo Jiménez. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Ingreso 2014-2.
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