Semblanza
Investigador Titular "B" de tiempo completo. Hizo sus estudios en biología en la Universidad de Los Andes en Bogotá (Colombia), para luego realizar una maestría y un doctorado en Ciencias Forestales, ambos en la Université Laval (Quebec, Canadá), con una beca del Ministerio de Educación de Québec. Antes de establecerse en México (en 2009), realizó una estancia postdoctoral en el CIFOR-INIA (Madrid, España) con una beca Juan de la Cierva del Ministerio Español de Ciencia e Innovación. Sus intereses científicos abordan cuestiones evolutivas que buscan responder cómo se origina y se mantiene la diversidad biológica. Usando árboles forestales como modelo y combinando perspectivas genómicas, históricas y geográficas, realiza estudios filogenéticos, filogeográficos y de genética del paisaje y de la conservación. Con ellos busca identificar regiones genómicas involucradas en la divergencia de lasespecies y su adaptación local. El objetivo último de estas investigaciones es bonificar programas forestales de manejo y conservación a través del entendimiento de los procesos evolutivos que enfrentan los bosques del país.
Es editor asociado de las revistas Tree Genetics and Genomes y Frontiers in Conservation Sciences
Su red de colaboradores se extiende por diversas instituciones de México, Estados Unidos, Canadá y varios países de Europa y Latinoamérica.
Aunque la mayoría de sus estudios se concentran en coníferas, particularmente oyameles (Abies), abetos (Picea) y pinos (Pinus), siempre está abierto a colaborar en proyectos con otros organismos. Ejemplos de estos incluyen estudios en mangles (Avicennia), álamos (Populus), Lauraceas, plantas domesticadas y sus parientes silvestres e incluso algunos hongos y animales.
Líneas de Investigación
- Genómica Ecológica de plantas
- Genética de poblaciones, del paisaje y filogeografía de árboles forestales
- Evolución molecular
DESCRIPCIÓN:
Buscamos entender los mecanismos genómicos y evolutivos que originan la diversidad biológica, desde la divergencia de las especies hasta la adaptación local entre poblaciones, y desde el nivel molecular hasta el fenotipo. Usando herramientas genómicas y bioinformáticas buscamos inferir parámetros cuantitativos, históricos, demográficos y medioambientales para entender la historia evolutiva de las especies y usarla para emitir recomendaciones de manejo y conservación.
PALABRAS CLAVE:
Adaptación, Genómica Ecológica, Ecología Urbana, Coníferas, Conservación, Evolución Molecular
PRINCIPALES COLABORADORES:
- En la UNAM: Luis Eguiarte, Rafel Lira, Daniel Piñero, David Gernandt, Alejandra Moreno, Juan Núnez, Lev Jardón, Santiago Ramírez, Jorge Nieto, Ella Vázquez, María del Carmen Madujano, Julio Campo
- En México: Christian Wehenkel (Universidad Juárez del Edo. de Durango), Alicia Mastretta-Yanes (CONACyT-CoNaBio), Alejandra Vázuez-Lobo (CIByC-UAEM), Cuahutemoc Saenz Romero (IIAF-Univ. Michoacana San Nicolás de Hidalgo), Andrés Lira-Noriega (Inst. Ecol. Xalapa), Antonio González-Rodríguez (IIES, Morelia)
- En el extranjero: Jean Bousquet, Jean Beaulieu, Damase P. Khasa (Univ. Laval, Canadá); Christophe Plomion, Santiago C. González-Martínez, Myriam Heuertz (UMR INRA-Univ. Bordeaux); Delphine Grivet, Ricardo Alía (CIFOR-INIA, España); Beppe Vendramin (Istituto di Genetica Vegetale-CNR, Italia); Jill Wegrzyn (Univ. Connecticut)
Formación Académica
- Pregrado (licenciatura) en biología, Universidad de Los Andes, Bogotá, Colombia. 1993-1998
(Tesis: Estudio poblacional de los genes APOE, APOB (3’VNTR) y ACE en comunidades negras e indígenas de Colombia)
- Maestría en ciencias forestales, Université Laval, Québec, Canadá. 1999-2000
(Tesis: Diferencia en las fuerzas evolutivas que actúan sobre los caracteres cuantitativos, las allozimas y los marcadores ESTP en poblaciones de abeto blanco (Picea glauca) de Québec)
- Doctorado en ciencias forestales, Université Laval, Québec, Canadá. 2001-2004
(Tesis: Diversidad genética mitocondrial de Picea mariana: un análisis filogeográfico de su área de distribución y de la zona de contacto con P. rubens)
- Postdoctorado, Université Laval - UNAM. 2005-2008
(Proyecto de investigación: Filogeografía y evolución de los Abies mexicanos)
- Postdoctorado, CIFOR-INIA, Ministerio de Ciencia e Innovación Español, Madrid, España. 2008-2009 (Proyecto de investigación: Genómica ecológica de Pinus pinsater)
Experiencia profesonal
Premios y Distinciones
Sistema Nacional de investigadores - Nivel II. A partir de enero de 2012
DGAPA-PRIDE - Nivel C. A partir de febrero de 2021
DGAPA-PASPA- Beca para estancia sabática en el extranjero. Agosto de 2017 a agosto de 2018
DGAPA-PAIPA - Nivel B. Octubre 2009 a abril 2011
DGAPA-PEII - Nivel B. Octubre 2009 a abril 2011
Beca Juan de la Cierva - Ministerio de Educación Español. 2008-2009
Beca de investigación (Fond de soutiens au doctorat) - Faculté de Foresterie et Géomatique, Université Laval. 2001-2004
Beca de excelencia - Ministère de l’Éducation du Québec. 1999-2003
Proyectos de Investigación Actuales
- Filogeografía, y adaptación local de oyameles (Abies) --- Proyecto disponible para realizar tesis de maestría o doctorado.
- Evolución de la tolerancia a la contaminación atmosférica en Abies.
- Filogenia y metagenómica de coníferas --- Proyecto disponible para realizar tesis de maestría o doctorado.
- Evolución molecular del genoma mitocondrial de coníferas --- Proyecto disponible para realizar tesis de maestría.
Publicaciones
Publicaciones selectas:
(para la lista completa ver perfil en loop.frontiers)
∴ Giles-Pérez G, Aguirre-Planter E, Eguiarte LE, Jaramillo-Correa JP. 2022. Demographic modelling helps tracking the rapid and recent divergence of a conifer species pair from central Mexico. Mol Ecol In press. https://doi.org/110.22541/au.162064326.66276060/v1.
∴ Arenas S, Cortés AJ, Mastretta-Yanes A, Jaramillo-Correa JP. 2021. Evaluating the accuracy of genomic prediction for the management and conservation of relictual natural tree populations. Tree Genet Genomes 17:12. https://doi.org/10.1007/s11295-020-01489-1.
∴ Jaramillo-Correa JP, Bagnoli F, Grivet D, Fady B, Aravanopoulus FA Vendramin GG, González-Martínez SC. 2020. Evolutionary rate and genetic load in an emblematic Mediterranean tree following an ancient and prolonged population collapse. Mol Ecol 29:4797-4811. https://doi.org/10.1111/mec.15684.
∴ Jaramillo-Correa JP, Grivet D, Lepoittevin C, Sebastiani F, Heuertz M, Garnier-Géré P, Alía R, Vendramin GG, Plomion C Gonzalez-Martinez SC. 2015. Molecular proxies of climate maladaptation in a long-lived tree. Genetics 199:793-807. Highlighted Article. Press Release. https://doi.org/10.1534/genetics.114.173252.
∴ Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Khasa DP, Bousquet J. 2009. Inferring the past from the present phylogeographic structure of North American Forest trees: seeing the forest for the genes. Can J Forest Res 39:286-307. Invited Review. https://doi.org/10.1139/X08-181.
∴ Jaramillo-Correa JP, Bousquet J. 2005. Mitochondrial genome recombination in the zone of contact between two hybridizing conifers. Genetics 171:1951-1962. https://doi.org/10.1534/genetics.105.042770.
Tesis Dirigidas
Doctorado
2020 – Verónica Reyes Galindo (codirección). « Relación entre la variación epigenética, la diversidad microbiana y la tolerancia a la contaminación ambiental en un bosque de Abies religiosa ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2018 – Gustavo I Giles Pérez. « Análisis de la arquitectura genómica de la adaptación local en las poblaciones de oyamel de la Faja Volcánica Transmexicana ». Posgrado en Ciencias biomédicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2016 – 2021 Sebastián Arenas Jiménez. « Variación fenotípica y predicción genómica en Abies religiosa (Pinaceae) ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2015 – 2020 Jorge Cruz Nicolás. « Una aproximación filogenética, morfológica, ecológica y genética para entender la dinámica evolutiva de oyameles mexicanos ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2011 – 2014 Carmen Zulema Quiñones Pérez (codirección). « Mapeo de la diversidad genética de Picea chihuahuana Martínez ». Facultad de Ciencias Agropecuarias y Forestales - Universidad Juárez del Estado de Durango, Durango.
Maestría
2022 – Edgar Castillo Soto. « Erosión y acumulación de carga genética entre clases de edades en un bosque de Abies religiosa: implicaciones para su manejo y conservación ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2019 – José Miguel Amaro Estrada. « Evolución molecular en miembros de la familia génica CDPK en coníferas boreales y subtropicales ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX
2016 – 2019 Verónica Reyes Galindo (codirección). « Análisis del transcriptoma en mecanismos involucrados en la tolerancia a ozono troposférico en Abies religiosa ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2014 –2018 Gustavo Ibrahim Giles Pérez. « Estructura genética y divergencia de dos especies de oyamel (Abies, Pinaceae) en la Faja Volcánica Transmexicana ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2013 – 2016 Rodrigo Iván Reyes Pérez. « Diagnóstico genético-ecológico de la población de Hemidactylus frenatus, un geco invasivo en México ». Posgrado en Ciencias biológicas e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX
Licenciatura
2014 – 2018 José Miguel Amaro Estrada. « Diferencias en la tasa de recombinación intrapoblacional en genes de copia única de Abies religiosa ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2014 – 2018 Omar Garduño Sánchez. « Evolución de regiones del genoma mitocondrial de pastos (Poaceae) ricas en microsatélites ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2014 – 2017 Paulina Chavarria. « Detección de fuerzas selectivas en poblaciones afectadas por cuellos de botella ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2012 – 2015 Iván Méndez González. « Genética del paisaje de los bosques de oyamel del Volcán Ajusco ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2010 – 2013 Julia Múgica Galart. « Determinación de grupos genéticos en abetos distribuidos a lo largo de la Faja Volcánica Transmexicana ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX.
2010 – 2012 Juan José Ramírez Lerma. « Caracterización de genes de la subfamilia de factores de transcripción R2R3-MYB en el abeto Abies religiosa ». Facultad de Ciencias e Instituto de Ecología - UNAM. CDMX
Contacto
- Teléfono: 555622-9015
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