Líneas de Investigación

El interés de nuestro grupo es estudiar los mecanismos epigenéticos y su función en plantas, para ello usamos como modelo biológico a la planta de Arabidopsis thaliana. En particular estamos enfocados en estudiar la función de los factores epigenéticos como integradores de señales ambientales y generadores de plasticidad y variación fenotípica en las plantas.

Las líneas de investigación que estamos llevan acabo están divididas en cinco ejes principales:

1) Estudio de la función de los factores epigenéticos del complejo Polycomb (PcG) y Trithorax (TrxG) en los procesos de proliferación y diferenciación durante el desarrollo radicular de Arabidopsis thaliana

2) Función de los factores epigenéticos en el mantenimiento del nicho de células troncales de la raíz de Arabidopsis.

3) Estudio de los factores epigenéticos PcG y TrxG como integradores de señales ambientales y generadores de variabilidad fenotípica

4) Estudio de la regulación epigenética y su relación con la plasticidad de las plantas ante estrés genotóxico

5) Estudio y generación de memoria epigenética a través de TrxG y PcG

 

Formación Académica

Licenciatura
Químico Farmacéutico Biólogo. Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

Doctorado
Doctorado en Ciencias. Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

Postdoctorado
Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” Madrid, España. 

Experiencia profesonal

 

Premios y Distinciones

PRIDE: "C"

SNI: II

Beca Marie Curie Fellowship. Fundación Europea Marie Curie.

Beca Short-Term EMBO Fellowship.

1) Estudio de la función de los factores epigenéticos del complejo Polycomb (PcG) y Trithorax (TrxG) en los procesos de proliferación y diferenciación durante el desarrollo radicular de Arabidopsis thaliana

2) Función de los factores epigenéticos en el mantenimiento del nicho de células troncales de la raíz de Arabidopsis.

3) Estudio de los factores epigenéticos PcG y TrxG como integradores de señales ambientales y generadores de variabilidad fenotípica

4) Estudio de la regulación epigenética y su relación con la plasticidad de las plantas ante estrés genotóxico

5) Estudio y generación de memoria epigenética a través de TrxG y PcG

1.         Ornelas-Ayala, D.; Vega-Leon, R.; Petrone-Mendoza, E.; Garay-Arroyo, A.; Garcia-Ponce, B.; Alvarez-Buylla, E.R.; Sanchez, M.P. ULTRAPETALA1 maintains Arabidopsis root stem cell niche independently of ARABIDOPSIS TRITHORAX1. The New phytologist 2020, 225, 1261-1272, doi:10.1111/nph.16213.

2.         Castelan-Munoz, N.; Herrera, J.; Cajero-Sanchez, W.; Arrizubieta, M.; Trejo, C.; Garcia-Ponce, B.; Sanchez, M.P.; Alvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. MADS-Box Genes Are Key Components of Genetic Regulatory Networks Involved in Abiotic Stress and Plastic Developmental Responses in Plants. Frontiers in plant science 2019, 10, 853, doi:10.3389/fpls.2019.00853.

3.         Cajero-Sanchez, W.; Aceves-Garcia, P.; Fernandez-Marcos, M.; Gutierrez, C.; Rosas, U.; Garcia-Ponce, B.; Alvarez-Buylla, E.R.; Sanchez, M.P.; Garay-Arroyo, A. Natural Root Cellular Variation in Responses to Osmotic Stress in Arabidopsis thaliana Accessions. Genes (Basel) 2019, 10, doi:10.3390/genes10120983.

4.         Alvarez-Buylla, E.R.; Garcia-Ponce, B.; Sanchez, M.P.; Espinosa-Soto, C.; Garcia-Gomez, M.L.; Pineyro-Nelson, A.; Garay-Arroyo, A. MADS-box genes underground becoming mainstream: plant root developmental mechanisms. The New phytologist 2019, 223, 1143-1158, doi:10.1111/nph.15793.

5.         Cajero Sánchez, W.; García-Ponce, B.; Sánchez, M.d.l.P.; Álvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. Identifying the transition to the maturation zone in three ecotypes of Arabidopsis thaliana roots. Communicative & Integrative Biology 2018, 11, e1395993, doi:10.1080/19420889.2017.1395993.

6.         Álvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A.; García-Ponce de León, B.; Sánchez, M.d.l.P.; González-Ortega, E.; Dávila-Velderrain, J.; Martínez-García, J.C.; Piñeyro-Nelson, A. La Ecología Evolutiva del Desarrollo en México. Revista Mexicana de Biodiversidad 2017, 88, 14-26, doi:https://doi.org/10.1016/j.rmb.2017.10.009.

7.         Garcia-Cruz, K.V.; Garcia-Ponce, B.; Garay-Arroyo, A.; Sanchez, M.P.; Ugartechea-Chirino, Y.; Desvoyes, B.; Pacheco-Escobedo, M.A.; Tapia-Lopez, R.; Ransom-Rodriguez, I.; Gutierrez, C., et al. The MADS-box XAANTAL1 increases proliferation at the Arabidopsis root stem-cell niche and participates in transition to differentiation by regulating cell-cycle components. Annals of botany 2016, 10.1093/aob/mcw126, doi:10.1093/aob/mcw126.

8.         Aceves-Garcia, P.; Alvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A.; Garcia-Ponce, B.; Munoz, R.; Sanchez Mde, L. Root Architecture Diversity and Meristem Dynamics in Different Populations of Arabidopsis thaliana. Frontiers in plant science 2016, 7, 858, doi:10.3389/fpls.2016.00858.

9.         Sanchez, M.P.; Aceves-Garcia, P.; Petrone, E.; Steckenborn, S.; Vega-Leon, R.; Alvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A.; Garcia-Ponce, B. The impact of Polycomb group (PcG) and Trithorax group (TrxG) epigenetic factors in plant plasticity. The New phytologist 2015, 208, 684-694, doi:10.1111/nph.13486.

10.       Rodriguez-Mega, E.; Pineyro-Nelson, A.; Gutierrez, C.; Garcia-Ponce, B.; Sanchez, M.P.; Zluhan-Martinez, E.; Alvarez-Buylla, E.R.; Garay-Arroyo, A. Role of transcriptional regulation in the evolution of plant phenotype: A dynamic systems approach. Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists 2015, 10.1002/dvdy.24268, doi:10.1002/dvdy.24268.

11.       Perez-Ruiz, R.V.; Garcia-Ponce, B.; Marsch-Martinez, N.; Ugartechea-Chirino, Y.; Villajuana-Bonequi, M.; de Folter, S.; Azpeitia, E.; Davila-Velderrain, J.; Cruz-Sanchez, D.; Garay-Arroyo, A., et al. XAANTAL2 (AGL14) Is an Important Component of the Complex Gene Regulatory Network that Underlies Arabidopsis Shoot Apical Meristem Transitions. Molecular plant 2015, 8, 796-813, doi:10.1016/j.molp.2015.01.017.

12.       Pedroza-Garcia, J.A.; Najera-Martinez, M.; Sanchez, M.P.; Plasencia, J. Arabidopsis thaliana thymidine kinase 1a is ubiquitously expressed during development and contributes to confer tolerance to genotoxic stress. Plant Mol Biol 2015, 87, 303-315, doi:10.1007/s11103-014-0277-7.

13.       Ortiz-Gutierrez, E.; Garcia-Cruz, K.; Azpeitia, E.; Castillo, A.; Sanchez, M.P.; Alvarez-Buylla, E.R. A Dynamic Gene Regulatory Network Model That Recovers the Cyclic Behavior of Arabidopsis thaliana Cell Cycle. PLoS Comput Biol 2015, 11, e1004486, doi:10.1371/journal.pcbi.1004486.

14.       Godinez-Palma, S.K.; Garcia, E.; Sanchez, M.P.; Rosas, F.; Vazquez-Ramos, J.M. Complexes of D-type cyclins with CDKs during maize germination. Journal of experimental botany 2013, 64, 5661-5671, doi:10.1093/jxb/ert340.

15.       Garay-Arroyo, A.; Ortiz-Moreno, E.; Sanchez, M.P.; Murphy, A.S.; Garcia-Ponce, B.; Marsch-Martinez, N.; de Folter, S.; Corvera-Poire, A.; Jaimes-Miranda, F.; Pacheco-Escobedo, M.A., et al. The MADS transcription factor XAL2/AGL14 modulates auxin transport during Arabidopsis root development by regulating PIN expression. The EMBO journal 2013, 32, 2884-2895, doi:10.1038/emboj.2013.216.

16.       Sanchez, M.P.; Costas, C.; Sequeira-Mendes, J.; Gutierrez, C. Regulating DNA replication in plants. Cold Spring Harb Perspect Biol 2012, 4, doi:10.1101/cshperspect.a010140.

17.       Garay-Arroyo, A.; Sanchez, M.P.; Garcia-Ponce, B.; Azpeitia, E.; Alvarez-Buylla, E.R. Hormone symphony during root growth and development. Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists 2012, 241, 1867-1885, doi:10.1002/dvdy.23878.

18.       Garay-Arroyo, A.; Pineyro-Nelson, A.; Garcia-Ponce, B.; Sanchez, M.P.; Alvarez-Buylla, E.R. When ABC becomes ACB. Journal of experimental botany 2012, 63, 2377-2395, doi:ers024 [pii]

10.1093/jxb/ers024.

19.       Sanmartin, M.; Sauer, M.; Munoz, A.; Zouhar, J.; Ordonez, A.; van de Ven, W.T.; Caro, E.; Sanchez, M.P.; Raikhel, N.V.; Gutierrez, C., et al. A molecular switch for initiating cell differentiation in Arabidopsis. Curr Biol 2011, 21, 999-1008, doi:S0960-9822(11)00483-0 [pii]

10.1016/j.cub.2011.04.041.

20.       Costas, C.; Sanchez, M.P.; Stroud, H.; Yu, Y.; Oliveros, J.C.; Feng, S.; Benguria, A.; Lopez-Vidriero, I.; Zhang, X.; Solano, R., et al. Genome-wide mapping of Arabidopsis thaliana origins of DNA replication and their associated epigenetic marks. Nat Struct Mol Biol 2011, 18, 395-400, doi:10.1038/nsmb.1988.

21.       Costas, C.; Sanchez, M.P.; Sequeira-Mendes, J.; Gutierrez, C. Progress in understanding DNA replication control. Plant Sci 2011, 181, 203-209, doi:S0168-9452(11)00160-9 [pii]

10.1016/j.plantsci.2011.04.020.

22.       Desvoyes, B.; Sanchez, M.P.; Ramirez-Parra, E.; Gutierrez, C. Impact of nucleosome dynamics and histone modifications on cell proliferation during Arabidopsis development. Heredity 2010, 105, 80-91, doi:hdy201050 [pii]

10.1038/hdy.2010.50.

23.       Sanchez, M.P.; Gutierrez, C. Arabidopsis ORC1 is a PHD-containing H3K4me3 effector that regulates transcription. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2009, 106, 2065-2070, doi:10.1073/pnas.0811093106.

24.       Sanchez, M.P.; Gutierrez, C. Novel insights into the plant histone code: lessons from ORC1. Epigenetics 2009, 4, 205-208, doi:10.4161/epi

25.       Sanchez, M.P.; Caro, E.; Desvoyes, B.; Ramirez-Parra, E.; Gutierrez, C. Chromatin dynamics during the plant cell cycle. Semin Cell Dev Biol 2008, 19, 537-546, doi:S1084-9521(08)00055-4 [pii]

10.1016/j.semcdb.2008.07.014.

26.       Caro, E.; Desvoyes, B.; Ramirez-Parra, E.; Sanchez, M.P.; Gutierrez, C. Endoreplication control during plant development. In Eukaryotic Cell Cycle, Bryant, J., Francis, D., Eds. Garland Science, Taylor and Francis group: London, UK, 2008; Vol. 59, pp. 167-187.

27.       Ramirez-Parra, E.; del Pozo, J.C.; Desvoyes, B.; M.P., S.; Gutierrez, C. E2F-DP transcription factors. In: Cell Cycle Control and Plant Development. In Annu. Plant Rev., Inzé, D., Ed. Blackwell Publishing: Oxford, 2007; Vol. 32, pp. 138-162.

28.       Sanchez, M.P.; Gurusinghe, S.H.; Bradford, K.J.; Vazquez-Ramos, J.M. Differential response of PCNA and Cdk-A proteins and associated kinase activities to benzyladenine and abscisic acid during maize seed germination. Journal of experimental botany 2005, 56, 515-523, doi:eri029 [pii]

10.1093/jxb/eri029.

29.       Diaz-Trivino, S.; del Mar Castellano, M.; Sanchez, M.P.; Ramirez-Parra, E.; Desvoyes, B.; Gutierrez, C. The genes encoding Arabidopsis ORC subunits are E2F targets and the two ORC1 genes are differently expressed in proliferating and endoreplicating cells. Nucleic Acids Res 2005, 33, 5404-5414, doi:33/17/5404 [pii]

10.1093/nar/gki854.

30.       Vazquez-Ramos, J.M.; Sanchez, M.P. PCNA-associated proteins during maize germination, Salamanca, Spain ed.; Nicolas, G., Bradford, K.J., Come, D., Eds.; 2003.

31.       Vazquez-Ramos, J.M.; Sanchez, M.P. The cell cycle and seed germination. Seed Science Research 2003, 13, 113-130, doi:10.1079/SSR2003130.

32.       Sanchez, M.P.; Torres, A.; Boniotti, M.B.; Gutierrez, C.; Vazquez-Ramo, J.M. PCNA protein associates to Cdk-A type protein kinases in germinating maize. Plant Mol Biol 2002, 50, 167-175, doi:10.1023/A:1016029001537.

33.       Herrera, I.; Sanchez, M.P.; Molina, J.; Plasencia, J.; Vazquez-Ramos, J.M. Proliferating cell nuclear antigen expression in maize seed development and germination: Regulation by phytohormones and its association with putative cell cycle proteins. Physiologia Plantarum 2000, 110, 127-134, doi:10.1034/j.1399-3054.2000.110117.x.

Licenciatura :

1.- Minely Cerón Bustamante. Estudio del gen AGAMOUS-like 19 (AGL19) en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana. Facultad de ciencias, UNAM.

2.- Steckenborn Díaz-Coria Stefan.  Función de HAM1 en respuesta a daño al DNA en la planta de Arabidopsis thaliana. Facultad de ciencias, UNAM.  Premio a mejor Tesis en el coloquio para estudiantes del I. Ecología. UNAM

3.-Petrone Mendoza Emilio. Función del gen ATX1 en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana. Facultad de ciencias, UNAM.  Mención honorífica a la mejor tesis en Biología del premio Carlos Enrique Chávez Solís

4.-Pamela Aceves. Variabilidad fenotípica en la raíz de Arabidopsis thaliana y su correlación con expresión génica. Facultad de ciencias, UNAM.

5.-María del Rosario Vega León. Estudio de la función antagónica de los factores epigenéticos CLF y ATX1 en Arabidopsis thaliana. Facultad de ciencias, UNAM. F

6.-María Teresa Alejo Vinogradova. LHP1 en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis: comprendiendo su función a través del análisis de mutantes. Facultad de ciencias, UNAM. Tesis con Mención honorífica.

7.- Daniela Monroy Peralta. Participación de LHP1 en el mantenimiento del meristemo apical de la raíz de Arabidopsis thaliana (Brassicaceae). Tesis en proceso

Maestría:

1.- Steckenborn Díaz-Coria Stefan. Caracterización de la histona acetilasa HAM1 durante la respuesta a daño al DNA en Arabidopsis thaliana. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. Tesis con mención honorífica

2.- Aceves García Pamela. Plasticidad de la raíz inducida por estrés osmótico en variantes naturales de Arabidopsis thaliana y su regulación por los factores epigenéticos ATX1 y CLF. Posgrado en ciencias Bioquímicas. Tesis con mención honorífica y candidato a medalla Alfonso Caso

3.- María del Rosario Vega León. Función de los factores epigenéticos ATX1 y CLF en la regulación de los genes de la familia MADS-box en Arabidopsis thaliana. Posgrado en ciencias Bioquímicas. Tesis con mención honorífica y candidato a medalla Alfonso Caso

4.- Nancy García Navarro. Variación natural en respuesta al daño al DNA y su asociación con factores epigenéticos. Posgrado en ciencias Bioquímicas.

5.- María Teresa Alejo Vinogradova. El desarrollo de la raíz de Arabidopsis descrito a través de LHP1. Tesis en proceso

Doctorado:

1.- Diego Arturo Ornelas Ayala. Función de ULT1 en el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana. Posgrado en ciencias Biomédicas. Tesis en proceso